RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 OR1E2P47887 323 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 RPP30P78346 268 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FADDQ13158 208 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 POTEKPQ9BYX7 375 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ACTR6Q9GZN1 396 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 RABL2BQ9UNT1 228 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 GLOD5A6NK44 160 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 CREG1O75629 220 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 RAB6AP20340 208 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MMP8P22894 467 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 GRM5P41594 1212 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 CASP6P55212 293 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 BCL2L15Q5TBC7 163 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 UBQLNLQ8IYU4 475 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 OR56A1Q8NGH5 318 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 GGT3PA6NGU5 568 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 NIPSNAP2O75323 286 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FGL2Q14314 439 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ACSBG2Q5FVE4 666 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 SKA3Q8IX90 412 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MARVELD2Q8N4S9 558 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 OR6C4Q8NGE1 309 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 EFCAB11Q9BUY7 163 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ITM2CQ9NQX7 267 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 DNM1LO00429 736 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCB7O75027 752 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 LAG3P18627 525 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ELK4P28324 431 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PIGGQ5H8A4 983 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 EGFL6Q8IUX8 553 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MOAP1Q96BY2 351 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ARMC1Q9NVT9 282 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ERVK13-1Q9NX77 482 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 DLG5Q8TDM6 1919 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FABP6P51161 128 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PXYLP1Q8TE99 480 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FAIMQ9NVQ4 179 aa17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 CD34P28906 385 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PSD4Q8NDX1 1056 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PCED1BQ96HM7 432 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MAS1P04201 325 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MMP3P08254 477 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FXYD4P59646 89 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 GPRC6AQ5T6X5 926 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPAN33Q86UF1 283 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 LRRTM4Q86VH4 590 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 OR2M4Q96R27 311 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 COQ3Q9NZJ6 369 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 CKMT1AP12532 417 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 GHRHRQ02643 423 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF1DP3Q658K8 133 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 DEFB119Q8N690 84 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 DCUN1D4Q92564 292 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PKP2Q99959 881 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ABRACLQ9P1F3 81 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 SRRDQ9UH36 339 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 CELP19835 753 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PTH2RP49190 550 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 AWAT2Q6E213 333 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 NIPAL3Q6P499 406 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 RADILQ96JH8 1075 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 NME7Q9Y5B8 376 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCA9Q8IUA7 1624 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 K7EPK0 472 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ACVR1BP36896 505 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 TSFMP43897 325 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF151Q2KHN1 245 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 MPP7Q5T2T1 576 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 C22orf42Q6IC83 251 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 TMEM205Q6UW68 189 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 LRIT3Q3SXY7 679 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF100Q8IYN0 542 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ARNTL2Q8WYA1 636 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 DEFB118Q96PH6 123 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 C14orf119Q9NWQ9 140 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 TAC3Q9UHF0 121 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 FZD10Q9ULW2 581 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.93■□□□□ 0.46
PTPRJ-207ENST00000613246 SPDEFO95238 335 aa17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.1 ms