RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-215	ENST00000596522	CYR61	O00622	381 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	B4GALT2	O60909	372 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SH3BGRL	O75368	114 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	MYO1D	O94832	1006 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ETHE1	O95571	254 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	B3GALT4	O96024	378 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PRB1	P04280	392 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ALPP	P05187	535 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	NR2F6	P10588	404 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PRPH2	P23942	346 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	MAPK12	P53778	367 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	POLE2	P56282	527 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TNFRSF17	Q02223	184 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	EXT1	Q16394	746 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	LPAR4	Q99677	370 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	FAIM2	Q9BWQ8	316 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	MCM8	Q9UJA3	840 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TIMM22	Q9Y584	194 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		13.33	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	DYRK3	O43781	588 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	CTNS	O60931	367 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	JRK	O75564	520 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM87A	P0C7U9	286 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	COX6A1	P12074	109 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	OR4D2	P58180	307 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	STX4	Q12846	297 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	RNF175	Q8N4F7	328 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	FAM47B	Q8NA70	645 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		13.32	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PCSK5	Q92824	1860 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PROM1	O43490	865 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	EED	O75530	441 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	CEACAM4	O75871	244 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SERPINA7	P05543	415 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	KLK1	P06870	262 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	CHRNG	P07510	517 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	COX7A2	P14406	83 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	HTR6	P50406	440 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	FOXA1	P55317	472 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	STX3	Q13277	289 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	MPP2	Q14168	576 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	GALNT16	Q8N428	558 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.31	□□□□□ -0.28
FCHO1-215	ENST00000596522	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13.31	□□□□□ -0.28

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