RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 RTL4Q6ZR62 310 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 FRA10AC1Q70Z53 315 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 TRILQ7L0X0 811 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC8AQ8IWT6 810 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM109AQ8N4B1 249 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 MYRIPQ8NFW9 859 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8K3Q8NH51 312 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 OR14A16Q8NHC5 309 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 NINJ1Q92982 152 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CFAP36Q96G28 342 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 SGCZQ96LD1 299 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXC2Q99958 501 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 NT5DC2Q9H857 520 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 VTI1BQ9UEU0 232 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 Q9UFV3 132 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CHMP2BQ9UQN3 213 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PSAT1Q9Y617 370 aa9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS13CQ709C8 3753 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 SUSD5O60279 629 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF4O60810 478 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 WDR1O75083 606 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CELA3AP09093 270 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL3P10147 92 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CD99P14209 185 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ADH7P40394 386 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 DNASE1L1P49184 302 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 DLX5P56178 289 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF4P78317 190 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 FOLH1Q04609 750 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 RCN2Q14257 317 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 TGFBIQ15582 683 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 TSNQ15631 228 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM47EQ6ZV65 393 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PDIK1LQ8N165 341 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC2A12Q8TD20 617 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD49Q8WVL7 239 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 SLCO2A1Q92959 643 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC39Q96DD0 335 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PWWP2AQ96N64 755 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 OR8D2Q9GZM6 311 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 EHD1Q9H4M9 534 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 SACM1LQ9NTJ5 587 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ATG4BQ9Y4P1 393 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX264Q9Y6I9 313 aa9.53□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 NCKAP5O14513 1909 aa9.52□□□□□ -0.88
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 C17orf105B2RV13 164 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 HCN1O60741 890 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 LDB3O75112 727 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CTAG2O75638 210 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6AP2O75787 350 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 P04436 131 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MAN2A2P49641 1150 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TAS2R39P59534 338 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TGM3Q08188 693 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 STX4Q12846 297 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 AKAP6Q13023 2319 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SERTAD2Q14140 314 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC10A1Q14973 349 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MORF4L2Q15014 288 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 MPEG1Q2M385 716 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 WLSQ5T9L3 541 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 OPN5Q6U736 354 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-226ENST00000593200 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms