RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 VTI1BQ9UEU0 232 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.75■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A0G2JNJ9 132 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1B0GVC2 190 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNSO60931 367 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 IST1P53990 364 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MTTPP55157 894 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 DLX5P56178 289 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 LIX1LQ8IVB5 337 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM79Q9BSE2 394 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8D2Q9GZM6 311 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 Q9UFV3 132 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23.74■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKDD1BA6NHY2 528 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZWINTO95229 277 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 NADKO95544 446 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 DNASE1L1P49184 302 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF4P78317 190 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXO1Q12778 655 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLM1Q8NBJ4 401 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 OR14A16Q8NHC5 309 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SLCO2A1Q92959 643 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRC5BQ9NZH0 403 aa23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 AQP7O14520 342 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 LDB3O75112 727 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6AP2O75787 350 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CCL3P10147 92 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ADH7P40394 386 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 STX4Q12846 297 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MORF4L2Q15014 288 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFBIQ15582 683 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO48Q5FWF7 155 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM47EQ6ZV65 393 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKMY2Q8IV38 441 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35F6Q8N357 371 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A12Q8TD20 617 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPZA3Q96KX2 299 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 F2RL3Q96RI0 385 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TMUB1Q9BVT8 246 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC24A3Q9HC58 644 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PRDM7Q9NQW5 492 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SACM1LQ9NTJ5 587 aa23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF407Q9C0G0 2248 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf105B2RV13 164 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 TAPBPO15533 448 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 MGAT5Q09328 741 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.394e-8■■■■■ 41.9
CAPNS1-211ENST00000590874 HYAL4Q2M3T9 481 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 OR8K3Q8NH51 312 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC39Q96DD0 335 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 SGCZQ96LD1 299 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 EHD1Q9H4M9 534 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ATG4BQ9Y4P1 393 aa23.71■■□□□ 1.39
CAPNS1-211ENST00000590874 ETHE1O95571 254 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CD99P14209 185 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNI3P19429 210 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CD22P20273 847 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ID2Q02363 134 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 RCN2Q14257 317 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF793Q6ZN11 406 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE3DQ7Z6J8 389 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA6LQ8N4H0 392 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ESAMQ96AP7 390 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CNPPD1Q9BV87 410 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPS2Q9BXY5 557 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CXXC4Q9H2H0 198 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC11Q9NVH1 559 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 WWOXQ9NZC7 414 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ACAD8Q9UKU7 415 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX12Q9UMY4 172 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SPG11Q96JI7 2443 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SUSD5O60279 629 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 P04436 131 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 MAN2A2P49641 1150 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SERTAD2Q14140 314 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 DOC2AQ14183 400 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 C1orf185Q5T7R7 199 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 OPN5Q6U736 354 aa23.69■■□□□ 1.38
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