RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 IL23RQ5VWK5 629 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 CES4AQ5XG92 561 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 CGB2Q6NT52 195 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 DTX1Q86Y01 620 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 DNAJC22Q8N4W6 341 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 TRIML2Q8N7C3 387 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 NETO1Q8TDF5 533 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 TESCQ96BS2 214 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf21Q9H246 121 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 TUBB1Q9H4B7 451 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 IL21RQ9HBE5 538 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 MYNNQ9NPC7 610 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 CCL27Q9Y4X3 112 aa6.96□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 PIEZO1Q92508 2521 aa6.96□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 C1orf226A1L170 272 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 HYKKA2RU49 373 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 B4E171 279 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 D6RAR5 112 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 H0YGG7 62 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 CCR10P46092 362 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 HMGCS1Q01581 520 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 FOXM1Q08050 763 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 KLF10Q13118 480 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 KIAA0040Q15053 153 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 STPG1Q5TH74 334 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 FCRL6Q6DN72 434 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.95□□□□□ -1.3
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SMAD4-210ENST00000590061 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 C16orf89Q6UX73 402 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 USP53Q70EK8 1073 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 COMMD6Q7Z4G1 85 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.95□□□□□ -1.3
SMAD4-210ENST00000590061 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.95□□□□□ -1.3
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