RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	MS4A12	Q9NXJ0	267 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ABI3	Q9P2A4	366 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PHF11	Q9UIL8	331 aa		18.78	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469		A0A1B0GTL3	188 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	PPP6C	O00743	305 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	VPS4B	O75351	444 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	MYO1D	O94832	1006 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SEMA3D	O95025	777 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ETHE1	O95571	254 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	WDPCP	O95876	746 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	IMPDH1	P20839	514 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CCT5	P48643	541 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	MEP1A	Q16819	746 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CAVIN3	Q969G5	261 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	EMCN	Q9ULC0	261 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	VPS4A	Q9UN37	437 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	SNX6	Q9UNH7	406 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		18.77	■□□□□ 0.6
PSME3-209	ENST00000589469	TLDC2	A0PJX2	215 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	OR5H15	A6NDH6	313 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	COPE	O14579	308 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MLYCD	O95822	493 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	F10	P00742	488 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	IFNA16	P05015	189 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MYL2	P10916	166 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PPP2R1B	P30154	601 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TNFSF10	P50591	281 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	STX4	Q12846	297 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SERTAD2	Q14140	314 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC153	Q494R4	210 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SGO1	Q5FBB7	561 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GPR180	Q86V85	440 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	NUDT13	Q86X67	352 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	BEST3	Q8N1M1	668 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC126	Q96EE4	140 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	C19orf60	Q96EN9	201 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF382	Q96SR6	550 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469		A0A0A6YYD5	115 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	EED	O75530	441 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	OR4F21	O95013	312 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PROC	P04070	461 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	KRT4	P19013	534 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CRHR1	P34998	444 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	BSG	P35613	385 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TNFRSF17	Q02223	184 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	LGI4	Q8N135	537 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	AHSP	Q9NZD4	102 aa		18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469		G3V2L1	256 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	PLIN3	O60664	434 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	LDB3	O75112	727 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CLCN2	P51788	898 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	LCP2	Q13094	533 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC63	Q8NA47	563 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	RDH11	Q8TC12	318 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	TANK	Q92844	425 aa		18.74	■□□□□ 0.59
PSME3-209	ENST00000589469	VMP1	Q96GC9	406 aa		18.74	■□□□□ 0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms