RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 NUDT4Q9NZJ9 180 aa17■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 CSMD1Q96PZ7 3565 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 COX6B1P14854 86 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 GMPRP36959 345 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 MSH2P43246 934 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 BMPR2Q13873 1038 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 TMEM35AQ53FP2 167 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 PPM1NQ8N819 430 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ACOT4Q8N9L9 421 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 PSD4Q8NDX1 1056 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 FAM57AQ8TBR7 257 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 UBTD2Q8WUN7 234 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ALG9Q9H6U8 611 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 NMRAL1Q9HBL8 299 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 MYOTQ9UBF9 498 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa16.99■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 A0A1B0GTH9 108 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 A8MVJ9 347 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 C19orf84I3L1E1 186 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 HS6ST1O60243 411 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 KERAO60938 352 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 FAM155BO75949 473 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 TUBB4AP04350 444 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 IFNA16P05015 189 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 CRABP2P29373 138 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SERPINB1P30740 379 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 STX2P32856 288 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 PTGS2P35354 604 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 RFC3P40938 356 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 PLTPP55058 493 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 STX4Q12846 297 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 NAB1Q13506 487 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SERTAD2Q14140 314 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 MED27Q6P2C8 311 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 HSDL2Q6YN16 418 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 CMC1Q7Z7K0 106 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 C7orf57Q8NEG2 295 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 OR8K3Q8NH51 312 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 EXT2Q93063 718 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 RASL10BQ96S79 203 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 RAB17Q9H0T7 212 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 IGSF5Q9NSI5 407 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 DEPPQ9NTK1 212 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 HPF1Q9NWY4 346 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 PDZD2O15018 2839 aa16.98■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 K7EPI3 171 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 OR2J2O76002 312 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 MAGEA4P43358 317 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 HK2P52789 917 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 GPR85P60893 370 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SLMAPQ14BN4 828 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 RAPH1Q70E73 1250 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ACBD4Q8NC06 268 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 OR7G3Q8NG95 312 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 FBF1Q8TES7 1133 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ASB15Q8WXK1 588 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 OPTCQ9UBM4 332 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ERVK-11Q9UQG0 969 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SPACA6W5XKT8 324 aa16.97■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ZNF407Q9C0G0 2248 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 CCDC189A1A4V9 331 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 UBXN8O00124 270 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 RTCAO00442 366 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 LDB3O75112 727 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SUPT3HO75486 399 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 OR6B1O95007 311 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 TGFB1P01137 390 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 MTHFD2P13995 350 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 SOX3P41225 446 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 KIR3DL1P43629 444 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 GUCY2DQ02846 1103 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 TRADDQ15628 312 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 DEPDC1Q5TB30 811 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 IL20RBQ6UXL0 311 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 CHSY3Q70JA7 882 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 CD163Q86VB7 1156 aa16.96■□□□□ 0.31
CTIF-206ENST00000588345 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms