RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 ACSL3O95573 720 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 PLAUP00749 431 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 IFNA16P05015 189 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 POU2F1P14859 743 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 IMPA1P29218 277 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 CCKARP32238 428 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 UGT2B10P36537 528 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 SLC1A1P43005 524 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 CDK9P50750 372 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 ACVR1Q04771 509 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 RGS1Q08116 209 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 SQLEQ14534 574 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 KCNJ11Q14654 390 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 ACSBG2Q5FVE4 666 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 PIGGQ5H8A4 983 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 CCDC181Q5TID7 509 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 BBS12Q6ZW61 710 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 C17orf64Q86WR6 236 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 CA13Q8N1Q1 262 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 MORN4Q8NDC4 146 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 SLC35G2Q8TBE7 412 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 WNT2BQ93097 391 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 ZNF597Q96LX8 424 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 DOHHQ9BU89 302 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 CNIH4Q9P003 139 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 NENFQ9UMX5 172 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 SH2B3Q9UQQ2 575 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 HYOU1Q9Y4L1 999 aa8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
GGA3-212ENST00000582376 A0A096LNT2 108 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 A0A1W2PNV4 684 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 URADA6NGE7 173 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 LRRC14BA6NHZ5 514 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 C16orf97H3BN30 126 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 GFYI3L273 518 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 PSMD3O43242 534 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 TCF21O43680 179 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 OR1F1O43749 312 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 SPOPO43791 374 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 NRDCO43847 1150 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 NIPSNAP2O75323 286 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 LRATO95237 230 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 GAS8O95995 478 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 IGHV4-39P01824 125 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 HPNP05981 417 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 TMEM253P0C7T8 217 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 RBP3P10745 1247 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 CDH1P12830 882 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 HNF1AP20823 631 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 CDKN1AP38936 164 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 HSD17B7P56937 341 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 RAB8AP61006 207 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 TBPL1P62380 186 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 ASPHQ12797 758 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 SLC13A2Q13183 592 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 MPEG1Q2M385 716 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 PARP6Q2NL67 630 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 CTSL3PQ5NE16 218 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 SCIMPQ6UWF3 145 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 LINC00523Q86TU6 105 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 ZNF321PQ8N8H1 164 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 OR52K1Q8NGK4 314 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 ACTL9Q8TC94 416 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 NT5CQ8TCD5 201 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 CAVIN3Q969G5 261 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 FAM136AQ96C01 138 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 ZNF778Q96MU6 729 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 TUBA1CQ9BQE3 449 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 SLC39A3Q9BRY0 314 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 OR8D2Q9GZM6 311 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 MAPRE3Q9UPY8 281 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.39□□□□□ -1.07
GGA3-212ENST00000582376 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms