RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548265.1

PACS2-207, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene PACS2, Length 402 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-207ENST00000548265 RMND5AQ9H871 391 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ZNF304Q9HCX3 659 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 DAPP1Q9UN19 280 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CROCCQ5TZA2 2017 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 H3BMH7 237 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 TM4SF5O14894 197 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PLD2O14939 933 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 FOXS1O43638 330 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 DKK1O94907 266 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 KCNK5O95279 499 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 B3GALT4O96024 378 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CCL4P13236 92 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 DDCP20711 480 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CALB2P22676 271 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 KIR3DL1P43629 444 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 RASSF2P50749 326 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 LIM2P55344 173 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 TNFRSF17Q02223 184 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 SNX32Q86XE0 403 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CA13Q8N1Q1 262 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 BMPERQ8N8U9 685 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 AMER3Q8N944 861 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 EHD3Q9NZN3 535 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PISDQ9UG56 409 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ENTPD4Q9Y227 616 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ASB4Q9Y574 426 aa14.6□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 LOC100653049A0A140TA62 436 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CAPN14A8MX76 684 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CLDN4O14493 209 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ANKRD28O15084 1053 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PROM1O43490 865 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CHST10O43529 356 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 TBX19O60806 448 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 KRT34O76011 436 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 UBOX5O94941 541 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 FURINP09958 794 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 IL10P22301 178 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PPP2R1BP30154 601 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 OLR1P78380 273 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ABHD18Q0P651 414 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 RUNX2Q13950 521 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 RCAN2Q14206 197 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ZSCAN26Q16670 478 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PDSS2Q86YH6 399 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 C7orf57Q8NEG2 295 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 CTRCQ99895 268 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 DUSP26Q9BV47 211 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 DDA1Q9BW61 102 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 APMAPQ9HDC9 416 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.59□□□□□ -0.07
PACS2-207ENST00000548265 A0A1W2PP18 115 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 AIFM1O95831 613 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 PGRP06401 933 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 NTSP30990 170 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 CLDN6P56747 220 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 MC1RQ01726 317 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 ART3Q13508 389 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 DSG2Q14126 1118 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 TIGD2Q4W5G0 525 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 C1orf189Q5VU69 101 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.58□□□□□ -0.08
PACS2-207ENST00000548265 TREML1Q86YW5 311 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms