RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546563.1

AC068993.2-201, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene AC068993.2, Length 395 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC068993.2-201ENST00000546563 LRRC61Q9BV99 259 aa3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 UBXN6Q9BZV1 441 aa3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CARD9Q9H257 536 aa3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 KCNMB3Q9NPA1 279 aa3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 TBC1D13Q9NVG8 400 aa3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 KCNN3Q9UGI6 736 aa3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 PRDM4Q9UKN5 801 aa3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 MACROD2A1Z1Q3 448 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CFAP73A6NFT4 308 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 A8MVM7 634 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SLC28A1O00337 649 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 PSMD3O43242 534 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 IDH3BO43837 385 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SSX5O60225 188 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 KIF5CO60282 957 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ECE2O60344 883 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GMNNO75496 209 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 NXPH2O95156 264 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CXCL14O95715 111 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SFTPBP07988 381 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GSTA2P09210 222 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 PRKAR1AP10644 381 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GHRP10912 638 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CCNA2P20248 432 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 STIP1P31948 543 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 HPDP32754 393 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SLC1A3P43003 542 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 NSFP46459 744 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ASMTP46597 345 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 RABIFP47224 123 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CLCN4P51793 760 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CNN1P51911 297 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 KCNK10P57789 538 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GMFBP60983 142 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SRP54P61011 504 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 IRX4P78413 519 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 HTD2P86397 168 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CDH18Q13634 790 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 METTL7BQ6UX53 244 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 DLEU7Q6UYE1 221 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 TAF8Q7Z7C8 310 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 STHQ8IWL8 128 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GPC2Q8N158 579 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 NIPA2Q8N8Q9 360 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 LEMD2Q8NC56 503 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 OR4A16Q8NH70 328 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 MIPOL1Q8TD10 442 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ARHGAP45Q92619 1136 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 KCNK16Q96T55 309 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SOSTQ9BQB4 213 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 UBAC1Q9BSL1 405 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 NYXQ9GZU5 481 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 WWTR1Q9GZV5 400 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ABCG4Q9H172 646 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 PIGVQ9NUD9 493 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SPASTQ9UBP0 616 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 TEKT2Q9UIF3 430 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 FBXL4Q9UKA2 621 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 PILRBQ9UKJ0 227 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 DNPEPQ9ULA0 475 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 EXOC7Q9UPT5 735 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 MTMR11A4FU01 709 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CHUKO15111 745 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 TEX28O15482 410 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 SYT7O43581 403 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 STBD1O95210 358 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 TRIM16O95361 564 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 MT-ND2P03891 347 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 PGK2P07205 417 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CHRNGP07510 517 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ACADSP16219 412 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CYP3A5P20815 502 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 PRKACGP22612 351 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 ACP1P24666 158 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 CAMLGP49069 296 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GPC3P51654 580 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GIT2Q14161 759 aa2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
AC068993.2-201ENST00000546563 KRT31Q15323 416 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms