RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 SACM1LQ9NTJ5 587 aa5.34□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 EDARQ9UNE0 448 aa5.34□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRK2Q5S007 2527 aa5.34□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 EML6Q6ZMW3 1958 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TO15178 435 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CELA2AP08217 269 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 RPL21P46778 160 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 MEOX1P50221 254 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 KCNK10P57789 538 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 RUNX2Q13950 521 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 NTRK2Q16620 822 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DEFB134Q4QY38 66 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 MED27Q6P2C8 311 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CHSY3Q70JA7 882 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 FRA10AC1Q70Z53 315 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TMPRSS11BQ86T26 416 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DTWD1Q8N5C7 304 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 OR2M7Q8NG81 312 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PRDM4Q9UKN5 801 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC22A14Q9Y267 594 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ARHGAP10A1A4S6 786 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 KRT87PA6NCN2 255 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKDD1BA6NHY2 528 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TTC36A6NLP5 189 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ACOX3O15254 700 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DYRK3O43781 588 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 WDR47O94967 919 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 HPNP05981 417 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC35E2BP0CK96 405 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 COX7A2P14406 83 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 HK2P52789 917 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DCAF7P61962 342 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 FOXO1Q12778 655 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CEBPEQ15744 281 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TRILQ7L0X0 811 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CEP97Q8IW35 865 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SULF2Q8IWU5 870 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PSD4Q8NDX1 1056 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 RGMAQ96B86 450 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CENPKQ9BS16 269 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ATG10Q9H0Y0 220 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 NFU1Q9UMS0 254 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CHMP2BQ9UQN3 213 aa5.33□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 FIGNL2A6NMB9 653 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 GOLGA8MH3BSY2 632 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CDC7O00311 574 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PROM1O43490 865 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ITGA10O75578 1167 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SNX4O95219 450 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 CLPSP04118 112 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ABHD2P08910 425 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC35E2P0CK97 266 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 PTGS2P35354 604 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 TIMP3P35625 211 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SERPINB9P50453 376 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC12A2P55011 1212 aa5.32□□□□□ -1.56
ANKRD49-208ENST00000544253 RNF4P78317 190 aa5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms