RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519020.5

FAM49B-210, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 5

Gene FAM49B, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-210ENST00000519020 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 RGMAQ96B86 450 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 ACTR8Q9H981 624 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 PHF11Q9UIL8 331 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.96□□□□□ -0.01
FAM49B-210ENST00000519020 DNAJC13O75165 2243 aa14.96□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MAST4O15021 2626 aa14.96□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 SLC25A12O75746 678 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 NEURL1O76050 574 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TGFB1P01137 390 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 GPR143P51810 404 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 SPINK14Q6IE38 97 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 OR4C11Q6IEV9 310 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MTFR2Q6P444 385 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ZNF793Q6ZN11 406 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 IFT20Q8IY31 132 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MORN4Q8NDC4 146 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 OR8K3Q8NH51 312 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 NCLNQ969V3 563 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 RELTQ969Z4 430 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 CSF3RQ99062 836 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 IPPKQ9H8X2 491 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 A8MUA0 341 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 LRRTM2O43300 516 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 NME2P1O60361 137 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MAN1A2O60476 641 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 SMIM24O75264 130 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ZFAND5O76080 213 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 IFNA16P05015 189 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 COX7A2P14406 83 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 NME2P22392 152 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 CPN2P22792 545 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 CASP6P55212 293 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 CUL3Q13618 768 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 LCA5Q86VQ0 697 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TMEM156Q8N614 296 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 AMER2Q8N7J2 671 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MTBPQ96DY7 904 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 GPR137Q96N19 417 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 NTMT1Q9BV86 223 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 DYRK3O43781 588 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ITGA10O75578 1167 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 UNC5CO95185 931 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 CLDN9O95484 217 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 RNF224P0DH78 156 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MST1P26927 711 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 CCNG1P51959 295 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 DCAKDQ8WVC6 231 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ATP6V1E2Q96A05 226 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 SCYL1Q96KG9 808 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 ART5Q96L15 291 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 FRMD6Q96NE9 622 aa14.93□□□□□ -0.02
FAM49B-210ENST00000519020 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms