RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518483.5

EXO1-208, Transcript of exonuclease 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene EXO1, Length 2,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EXO1-208	ENST00000518483	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ESCO2	Q56NI9	601 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	NTN4	Q9HB63	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	B9D1	Q9UPM9	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	PDE9A	O76083	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	RCAN2	Q14206	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CBLN3	Q6UW01	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ART5	Q96L15	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	LHPP	Q9H008	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	OR1F1	O43749	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	PPP3CB	P16298	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TSPAN8	P19075	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	GK	P32189	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ZNF75D	P51815	510 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ADPRH	P54922	357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	IKZF1	Q13422	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CDH18	Q13634	790 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	IL18	Q14116	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	OR4N2	Q8NGD1	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	SLC26A7	Q8TE54	656 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CD8B2	A6NJW9	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483		J3QR06	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	NDUFS4	O43181	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	LCA5L	O95447	670 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	HLA-DOA	P06340	250 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	CSN3	P07498	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	HRH2	P25021	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	PPP2R1B	P30154	601 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	NAMPT	P43490	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
EXO1-208	ENST00000518483	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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