RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST10	O43529	356 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	UBOX5	O94941	541 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	IMPA1	P29218	277 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX19	P40855	299 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SSR4	P51571	173 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DLX5	P56178	289 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CUL1	Q13616	776 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GBX1	Q14549	363 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	EMC4	Q5J8M3	183 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PRELID2	Q8N945	189 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	IL22	Q9GZX6	179 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LDAH	Q9H6V9	325 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TREX1	Q9NSU2	369 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HPF1	Q9NWY4	346 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GALP	Q9UBC7	116 aa		10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CTAGE9	A4FU28	777 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	OR14I1	A6ND48	311 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	AP3B1	O00203	1094 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1F1	O43749	312 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO1D	O94832	1006 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	RAF1	P04049	648 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	INHBB	P09529	407 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GLI4	P10075	376 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH1	P12830	882 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ALOX12	P18054	663 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MAOA	P21397	527 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	BTG2	P78543	158 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS1	Q08116	209 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM198	Q66K66	360 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS9BP	Q6ZS82	235 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD13	Q7L211	337 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PALM2	Q8IXS6	379 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB15	Q8WXK1	588 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD3	Q96ES6	412 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SARG	Q9BW04	601 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PAK5	Q9P286	719 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9UFV3	132 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NNC1	897 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511		G3V3Y1	287 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LIAS	O43766	372 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP104	O60308	925 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR1	O75083	606 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	AVIL	O75366	819 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC3A	O75596	197 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MPC1L	P0DKB6	136 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ETS1	P14921	441 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	PAM	P19021	973 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MGAT1	P26572	445 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	GDNF	P39905	211 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	HNF4A	P41235	474 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NPY2R	P49146	381 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	MAN2A2	P49641	1150 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX1	Q13596	522 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS6KA1	Q15418	735 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		10.05	□□□□□ -0.8
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2M7	Q8NG81	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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