RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 NKX2-6A6NCS4 301 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 SYCE1LA8MT33 242 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 KERAO60938 352 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 RBP1P09455 135 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 GRK3P35626 688 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 SULF2Q8IWU5 870 aa21.57■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 VPS11Q9H270 941 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 ARL15Q9NXU5 204 aa21.57■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 SENP1Q9P0U3 644 aa21.57■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa21.56■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 CDC7O00311 574 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 FCHO1O14526 889 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 KRT15P19012 456 aa21.56■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 SKP1P63208 163 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 NIPAL1Q6NVV3 410 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 QSOX2Q6ZRP7 698 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 FRA10AC1Q70Z53 315 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 GPSM1Q86YR5 675 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF740Q8NDX6 193 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 RND1Q92730 232 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 GPR78Q96P69 363 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF559Q9BR84 538 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 SGPP1Q9BX95 441 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 UCK2Q9BZX2 261 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 KCNJ16Q9NPI9 418 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 TBK1Q9UHD2 729 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 DCDC2Q9UHG0 476 aa21.56■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 FAM90A27PA6NNH2 459 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 CHST10O43529 356 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 HS6ST1O60243 411 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 PRMT3O60678 531 aa21.55■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 ALOX12P18054 663 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 SLCO1A2P46721 670 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 DLG1Q12959 904 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 TGFBIQ15582 683 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa21.55■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 LCTLQ6UWM7 567 aa21.55■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa21.55■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.55■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 RFC3P40938 356 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF844Q08AG5 666 aa21.54■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 DEFB134Q4QY38 66 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 EMC4Q5J8M3 183 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 CES4AQ5XG92 561 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 SULT1C3Q6IMI6 304 aa21.54■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 TMEM200AQ86VY9 491 aa21.54■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 OR56A3Q8NH54 315 aa21.54■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 NUDT4Q9NZJ9 180 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 IKZF3Q9UKT9 509 aa21.54■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 RNF112Q9ULX5 631 aa21.54■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
SIMC1-208ENST00000495423 B4GALT2O60909 372 aa21.53■■□□□ 1.04
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SIMC1-208ENST00000495423 KRT71Q3SY84 523 aa21.53■■□□□ 1.04
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