RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492779.5

RBM39-237, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,316 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-237ENST00000492779 NAGAP17050 411 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TNFRSF4P43489 277 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CSNK1DP48730 415 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TTPAP49638 278 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TAS2R38P59533 333 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CHRNEQ04844 493 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ENPP2Q13822 863 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 MPEG1Q2M385 716 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 OLIG3Q7RTU3 272 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 METTL4Q8N3J2 472 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SLC5A8Q8N695 610 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 GANCQ8TET4 914 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ATL1Q8WXF7 558 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 EDAQ92838 391 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SCAMP4Q969E2 229 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TPD52L3Q96J77 140 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 GABRG3Q99928 467 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 EHD1Q9H4M9 534 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 FZD3Q9NPG1 666 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 WWOXQ9NZC7 414 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 RHCGQ9UBD6 479 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 C3orf18Q9UK00 162 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SATB2Q9UPW6 733 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SMIM30A4D0T7 59 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 FAM25EA8MYX2 175 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 K7ESM1 405 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 HAT1O14929 419 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SCAMP1O15126 338 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SGTAO43765 313 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 FAM20BO75063 409 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 NTN1O95631 604 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 GABRB1P18505 474 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 MAOBP27338 520 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 AOAHP28039 575 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 AKT1P31749 480 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 KDELR2P33947 212 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 P2RY2P41231 377 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 PIK3CBP42338 1070 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CLDN8P56748 225 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 MC1RQ01726 317 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SIGLEC14Q08ET2 396 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 NPRL3Q12980 569 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SQSTM1Q13501 440 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CST6Q15828 149 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 FAHD1Q6P587 224 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SLC51BQ86UW2 128 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 NLRP8Q86W28 1048 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 EID3Q8N140 333 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 NAGSQ8N159 534 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CDC26Q8NHZ8 85 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 FEVQ99581 238 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 NTMT1Q9BV86 223 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ZNF700Q9H0M5 742 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-237ENST00000492779 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms