RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.82□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COQ7Q99807 217 aa14.82□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.82□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.82□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPP7Q9UHL4 492 aa14.82□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCN2BO60939 215 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CXCR2P25025 360 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRT20P35900 424 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBA3CQ13748 450 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OLIG3Q7RTU3 272 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPERTQ8NA61 448 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR56A3Q8NH54 315 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PROX1Q92786 737 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPRKBQ9Y3C4 175 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SUV39H1O43463 412 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UGT2B11O75310 529 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ALPPL2P10696 532 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMP2P13473 410 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD6P30203 668 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TAS2R50P59544 299 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MVKQ03426 396 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SERPINA11Q86U17 422 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AMER3Q8N944 861 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SETD9Q8NE22 299 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F2RL3Q96RI0 385 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MROQ9BYG7 248 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RHCGQ9UBD6 479 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.81□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC16A6O15403 523 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHGA12O60330 932 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 JRKO75564 520 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FPR1P21462 350 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PNLIPRP1P54315 467 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2CBP62714 309 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2CAP67775 309 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLCA4Q14CN2 919 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 P3H2Q8IVL5 708 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SFTPA2Q8IWL1 248 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOL4Q9BPW4 351 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RLIMQ9NVW2 624 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PQU0 124 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GLOD5A6NK44 160 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 J3KTA2 159 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7EQS6 105 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC16A5O15375 505 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RGS10O43665 173 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDH12P55289 794 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC13A2Q13183 592 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RFX4Q33E94 735 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM4DQ6B0I6 523 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MED27Q6P2C8 311 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHISA5Q8N114 240 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C12orf66Q96MD2 445 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLEC1BQ9P126 229 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKMY1Q9P2S6 941 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.8□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POM121BA6NF01 834 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C6orf47O95873 294 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APODP05090 189 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RYKP34925 604 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC19A1P41440 591 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GABARAPL2P60520 117 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.79□□□□□ -0.04
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LIPJQ5W064 366 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.9 ms