RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478588.5

AFF4-208, Transcript of AF4/FMR2 family member 4, human

TSL 3

Gene AFF4, Length 897 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFF4-208	ENST00000478588	SORD	Q00796	357 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	TMED1	Q13445	227 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ENPP2	Q13822	863 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ZNF234	Q14588	700 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SNCB	Q16143	134 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	KRT71	Q3SY84	523 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ALF	Q53S48	1182 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	RLN3	Q8WXF3	142 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
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AFF4-208	ENST00000478588	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	FMO2	Q99518	471 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ANK1	P16157	1881 aa		4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	NUP210	Q8TEM1	1887 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	COL4A2	P08572	1712 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CEP250	Q9BV73	2442 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	LNP1	A1A4G5	178 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SEC14L5	O43304	696 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	RTN2	O75298	545 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	FGG	P02679	453 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	DNTT	P04053	509 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
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AFF4-208	ENST00000478588	CYP11B1	P15538	503 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ATP5D	P30049	168 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	HLA-F	P30511	346 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	PTGER3	P43115	390 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	MAPK9	P45984	424 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	DNA2	P51530	1060 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	DR1	Q01658	176 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CCDC6	Q16204	474 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	FUT11	Q495W5	492 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
AFF4-208	ENST00000478588	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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