RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXL4Q9UKA2 621 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PTCH1Q13635 1447 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MTMR11A4FU01 709 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DCXO43602 365 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MBD3O95983 291 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXC6P09630 235 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GP9P14770 177 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MSH3P20585 1137 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCKBRP32239 447 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CA8P35219 290 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ACADSBP45954 432 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5OP48047 213 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCR4P51679 360 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LIMK2P53671 638 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NAPAP54920 295 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MYL7Q01449 175 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GRB14Q14449 540 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MEF2DQ14814 521 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1C1Q15619 314 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TPGS2Q68CL5 300 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ASPHD2Q6ICH7 369 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LUZP1Q86V48 1076 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF441Q8N8Z8 693 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 BRSK1Q8TDC3 778 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 P3H4Q92791 437 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NXPE2Q96DL1 559 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEANC2Q96MN5 208 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS35Q96QK1 796 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC4AQ9UMR7 237 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF16BQ96L93 1317 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 H0Y8G0 127 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FZD7O75084 574 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 EML2O95834 649 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NUDT3O95989 172 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV4-39P01824 125 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CEBPBP17676 345 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 AXLP30530 894 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ACADVLP49748 655 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DPTQ07507 201 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB17Q13105 803 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FHL2Q14192 279 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PDK3Q15120 406 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FGD3Q5JSP0 725 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A4Q6P5W5 647 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 G2E3Q7L622 706 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO32Q969P5 355 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LRR1Q96L50 414 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NEDD4LQ96PU5 975 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC77Q9BR77 488 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZPBPQ9BS86 351 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 WWP1Q9H0M0 922 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC4Q9HBW1 653 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 AIPL1Q9NZN9 384 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 EPHA6Q9UF33 1036 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 B9D1Q9UPM9 204 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 COX11Q9Y6N1 276 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CUX2O14529 1486 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF222A6NCQ9 220 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ASPDHA6ND91 283 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM47DPA6NHR8 397 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 PROB1E7EW31 1015 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 EXTL3O43909 919 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFA7O95182 113 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 IL1BP01584 269 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP11B1P15538 503 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF12P17014 697 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 GPX3P22352 226 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 CTNNA2P26232 953 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM23P36406 574 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 NPY2RP49146 381 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGGTB-209ENST00000473406 RGS4P49798 205 aa5.41□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms