RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 NUBP1P53384 320 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 XKR7Q5GH72 579 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PIGGQ5H8A4 983 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TPRG1LQ5T0D9 272 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 KIF18BQ86Y91 864 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 EID2BQ96D98 161 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 LRCH3Q96II8 777 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FRMD6Q96NE9 622 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC30A3Q99726 388 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NPAS2Q99743 824 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRSS21Q9Y6M0 314 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PTPRSQ13332 1948 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FABP12A6NFH5 140 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PLD2O14939 933 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 B3GALT2O43825 422 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRAMEF10O60809 474 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRPS2P11908 318 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NR4A1P22736 598 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 LHCGRP22888 699 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RHDQ02161 417 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PWP1Q13610 501 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 NFATC4Q14934 902 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TMPRSS11BQ86T26 416 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FBXL6Q8N531 539 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MINDY1Q8N5J2 469 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 OR4F6Q8NGB9 312 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 DTD2Q96FN9 168 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TPD52L3Q96J77 140 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CGREF1Q99674 301 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 BRINP2Q9C0B6 783 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRSS16Q9NQE7 514 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZNF232Q9UNY5 417 aa7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PP18 115 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 J3QRK9 145 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SOX30O94993 753 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PTTG1O95997 202 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RAP2AP10114 183 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CDH1P12830 882 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 GGT5P36269 586 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC6A11P48066 632 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 AGTR2P50052 363 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 UGT2B15P54855 530 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IL18Q14116 193 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CARTPTQ16568 116 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FGD3Q5JSP0 725 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TCTE1Q5JU00 501 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ZNF614Q8N883 585 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FBXO27Q8NI29 283 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 FBXL8Q96CD0 374 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ASIC5Q9NY37 505 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 H0YAE9 185 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 WWP2O00308 870 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ATP6AP2O75787 350 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PITPNAQ00169 270 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SMCO1Q147U7 214 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TMEM44Q2T9K0 475 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PAOXQ6QHF9 649 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 KRT77Q7Z794 578 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 MOCOSQ96EN8 888 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ITCHQ96J02 903 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ANGPT4Q9Y264 503 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 IFT52Q9Y366 437 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 TIMM22Q9Y584 194 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPW3 197 aa7.34□□□□□ -1.23
USP54-210ENST00000466048 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms