RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 BLACEA4D250 179 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 GABRR3A8MPY1 467 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 PRAMEF2O60811 474 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 CBX6O95503 412 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ARFIP1P53367 373 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 CDH13P55290 713 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 CUL3Q13618 768 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 TUBA3CQ13748 450 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 FRG2Q64ET8 278 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 MZB1Q8WU39 189 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 FAR1Q8WVX9 515 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 FRG2BQ96QU4 278 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.4■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC18AA5D8T8 446 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 LDB3O75112 727 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 ETHE1O95571 254 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 OTCP00480 354 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 GSTA1P08263 222 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 TSPAN8P19075 237 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 CD96P40200 585 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 SLCO1A2P46721 670 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 CLCN2P51788 898 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 IFT88Q13099 833 aa22.39■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 INAQ16352 499 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 FHL5Q5TD97 284 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC18BQ6UXF7 455 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 GPR180Q86V85 440 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 BCORP1Q8N888 145 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 CLEC18CQ8NCF0 446 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 OR4F6Q8NGB9 312 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 PRR7Q8TB68 274 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 SERPINI1Q99574 410 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 PHF11Q9UIL8 331 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa22.39■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa22.38■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 PTPN13Q12923 2485 aa22.38■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.38■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 HERVK_113P63132 956 aa22.38■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF766Q5HY98 468 aa22.38■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.38■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 NCLNQ969V3 563 aa22.38■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 VMP1Q96GC9 406 aa22.38■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.38■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.38■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.38■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 PPT2Q9UMR5 302 aa22.38■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 PPP6CO00743 305 aa22.37■■□□□ 1.17
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SMKR1-201ENST00000462322 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 BSGP35613 385 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 MLF1P58340 268 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 ID2Q02363 134 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 CLCQ05315 142 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 OR1C1Q15619 314 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 SGO1Q5FBB7 561 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 CYP20A1Q6UW02 462 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 TAAR6Q96RI8 345 aa22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SMKR1-201ENST00000462322 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
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