RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459566.1

RNU6-274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-274P-201ENST00000459566 PNMA2Q9UL42 364 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 FBXO7Q9Y3I1 522 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 SEC16AO15027 2179 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CENPEQ02224 2701 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PLXNB1O43157 2135 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 RNF123Q5XPI4 1314 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ZFHX3Q15911 3703 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 A0A1W2PR77 199 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 LRRD1A4D1F6 860 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 SIGLEC5O15389 551 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MED24O75448 989 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MT2AP02795 61 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 DNTTP04053 509 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MT1AP04731 61 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 IGHV4-34P06331 123 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CISD3P0C7P0 127 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CD27P26842 260 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 OTX2P32243 289 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MAP2K4P45985 399 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 SLC1A6P48664 564 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ERFP50548 548 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 VAMP7P51809 220 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 GALCP54803 685 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 RAG2P55895 527 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CLDN6P56747 220 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ACTA1P68133 377 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MT1HP80294 61 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MT1XP80297 61 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 VLDLRP98155 873 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 IL9RQ01113 521 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PDE7AQ13946 482 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 GIT2Q14161 759 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 GGTLC2Q14390 218 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PHKG1Q16816 387 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TPRXLQ17RH7 258 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ECSCRQ19T08 205 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 C14orf28Q4W4Y0 310 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 LY6G6FQ5SQ64 297 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ANO1Q5XXA6 986 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TATDN1Q6P1N9 297 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ZNF880Q6PDB4 577 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 Q6ZR03 302 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 C19orf35Q6ZS72 473 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TMEM26Q6ZUK4 368 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ADGRF2Q8IZF7 708 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MT1MQ8N339 61 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PRSS35Q8N3Z0 413 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ZNF781Q8N8C0 355 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PROX1Q92786 737 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 FAM149B1Q96BN6 582 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TMEM101Q96IK0 257 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 FAM210BQ96KR6 192 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 KLHL5Q96PQ7 755 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MAP7D2Q96T17 732 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TPK1Q9H3S4 243 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 Q9H8V8 135 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ESM1Q9NQ30 184 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 WDR35Q9P2L0 1181 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ERVW-1Q9UQF0 538 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ZNF148Q9UQR1 794 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 PDE10AQ9Y233 779 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 TMED3Q9Y3Q3 217 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 NPHP3Q7Z494 1330 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 MICAL3Q7RTP6 2002 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 A0A1W2PNN7 141 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 NKX2-6A6NCS4 301 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 A6NDX4 124 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ZNF724A8MTY0 619 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 A8MUU9 505 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 C10orf142B7Z368 130 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 K7N7A8 449 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 ABCD4O14678 606 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 XRCC3O43542 346 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 NDUFS3O75489 264 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 SEC14L2O76054 403 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 CSTBP04080 98 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 HOXB7P09629 217 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-274P-201ENST00000459566 SBK2P0C263 348 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms