RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	RNF175	Q8N4F7	328 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TM9SF4	Q92544	642 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TANK	Q92844	425 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf44	Q96CB5	159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CDK2AP1	O14519	115 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PROM1	O43490	865 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CRCP	O75575	148 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FGF4	P08620	206 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PRR35	P0CG20	571 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CREB1	P16220	341 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CPN2	P22792	545 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	GSTM5	P46439	218 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	OR4D2	P58180	307 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	BTG2	P78543	158 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SLC13A2	Q13183	592 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	AGAP4	Q96P64	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT9	Q9BW91	350 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	WDR41	Q9HAD4	459 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TP53TG5	Q9Y2B4	290 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ASB4	Q9Y574	426 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	DPM1	O60762	260 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SH3BGRL	O75368	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	EED	O75530	441 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CHEK2	O96017	543 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINB4	P48594	390 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241		Q0VFX4	171 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	HDX	Q7Z353	690 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CUZD1	Q86UP6	607 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SHISA5	Q8N114	240 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FAM47B	Q8NA70	645 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TSLP	Q969D9	159 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TLCD1	Q96CP7	247 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	LMF1	Q96S06	567 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CSF3R	Q99062	836 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	ACPT	Q9BZG2	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	MMP25	Q9NPA2	562 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	AZIN1	O14977	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	KALRN	O60229	2985 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	TMPRSS11D	O60235	418 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NR2F6	P10588	404 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	NEFH	P12036	1026 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PTPA-222	ENST00000445241	MAOA	P21397	527 aa		13.71	□□□□□ -0.21

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