RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 AK1P00568 194 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RHCEP18577 417 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CCR1P32246 355 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SOAT1P35610 550 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ARMCX2Q7L311 632 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF511Q8NB15 262 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KCNC2Q96PR1 638 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CDC6Q99741 560 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CHRDQ9H2X0 955 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACKR4Q9NPB9 350 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0G2JMP0 313 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA0513O60268 411 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC22A3O75751 556 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 DDAH1O94760 285 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MT-CO1P00395 513 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FGBP02675 491 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ALPPP05187 535 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CRYBA1P05813 215 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CSF2RBP32927 897 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GABRA2P47869 451 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 IDH3AP50213 366 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 NKX3-2P78367 333 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PIGFQ07326 219 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MGAT3Q09327 533 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GCKRQ14397 625 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 IRF4Q15306 451 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR4N4Q8N0Y3 316 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CCNYQ8ND76 341 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR4M2Q8NGB6 313 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SMARCD2Q92925 531 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1191Q96A73 305 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA13Q96N96 652 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 COL21A1Q96P44 957 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TLR9Q9NR96 1032 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FLRT1Q9NZU1 646 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GULP1Q9UBP9 304 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CORO2BQ9UQ03 480 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GTW7 788 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MTMR11A4FU01 709 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L3A6NCW0 530 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR6C68A6NDL8 312 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TBX19O60806 448 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CILPO75339 1184 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ADRB3P13945 408 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FABP4P15090 132 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRKACGP22612 351 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 S100A11P31949 105 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SKP2Q13309 424 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 VWA1Q6PCB0 445 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MYO19Q96H55 970 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 RNF157Q96PX1 679 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF382Q96SR6 550 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 INTS14Q96SY0 518 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A7Q99884 636 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 SDCBP2Q9H190 292 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 GPR173Q9NS66 373 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 A8MXE2 369 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 KCNU1A8MYU2 1149 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ALG1L2C9J202 215 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PRRG1O14668 218 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 ABCD4O14678 606 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 PMP2P02689 132 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 OR8U8P0C7N1 319 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 COX5BP10606 129 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 FCER1AP12319 257 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRC-209ENST00000442510 LTKP29376 864 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms