RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389048.7

ALK-201, Transcript of ALK receptor tyrosine kinase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALK, Length 6,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALK-201ENST00000389048 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 KLBQ86Z14 1044 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TWNKQ96RR1 684 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 H7C417 338 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 IRAK2O43187 625 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HCRTR2O43614 444 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ABCB7O75027 752 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 RPS17P08708 135 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GPR4P46093 362 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PSKH2Q96QS6 385 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 DHDHQ9UQ10 334 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HMX3A6NHT5 357 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 YY2O15391 372 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ZNF254O75437 659 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PDYNP01213 254 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MYLK3Q32MK0 819 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 Q8N402 240 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 STK35Q8TDR2 534 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 EBF1Q9UH73 591 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 A0A1W2PQY0 241 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 A6NLC8 198 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FBP2O00757 339 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HTR7P34969 479 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GNMTQ14749 295 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CHADLQ6NUI6 762 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 EPHA6Q9UF33 1036 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CLEC4EQ9ULY5 219 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 NPIPA2E9PIF3 369 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 NPIPA3F8WFD2 350 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 AHSA1O95433 338 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ITFG2Q969R8 447 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 OR51B6Q9H340 312 aa14.95□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FMO6PO60774 539 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 KCNJ11Q14654 390 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HAPLN3Q96S86 360 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 WDR45Q9Y484 360 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 DLGAP1O14490 977 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CNTN5O94779 1100 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 LCKP06239 509 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 RAB4AP20338 218 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ZNF773Q6PK81 442 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CARM1Q86X55 608 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 OSTF1Q92882 214 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 POU3F4P49335 361 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 DIO3P55073 304 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GRB7Q14451 532 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FBXO43Q4G163 708 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ARL6Q9H0F7 186 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GLS2Q9UI32 602 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 AK4P27144 223 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FUT2Q10981 343 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 THAP4Q8WY91 577 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 RAD9AQ99638 391 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 CD244Q9BZW8 370 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 KCNK12Q9HB15 430 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 LRRC42Q9Y546 428 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FAM159BA6NKW6 160 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 LMF1Q96S06 567 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SYT4Q9H2B2 425 aa14.94□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MEIS3P1A6NDR6 274 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GNB3P16520 340 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 TNFRSF1BP20333 461 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FPR1P21462 350 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 GPM6BQ13491 265 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SLC36A3Q495N2 470 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 FAM86B1Q8N7N1 296 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.93□□□□□ -0.02
ALK-201ENST00000389048 MR1Q95460 341 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms