RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368916.1

GABPB2-201, Transcript of GA binding protein transcription factor subunit beta 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GABPB2, Length 1,680 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB2-201ENST00000368916 ZNF623O75123 536 aa7.13□□□□□ -1.27
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GABPB2-201ENST00000368916 ARIH2O95376 493 aa7.13□□□□□ -1.27
GABPB2-201ENST00000368916 PAHP00439 452 aa7.13□□□□□ -1.27
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GABPB2-201ENST00000368916 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.12□□□□□ -1.27
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