RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 ANKRD10Q9NXR5 420 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-201ENST00000344376 PHF11Q9UIL8 331 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-201ENST00000344376 FBXW2Q9UKT8 454 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-201ENST00000344376 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-201ENST00000344376 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-201ENST00000344376 RELNP78509 3460 aa15.02■□□□□ -0
ATG4B-201ENST00000344376 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TAC1P20366 129 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SLC29A2Q14542 456 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TEX35Q5T0J7 233 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 LRRN4CLQ8ND94 238 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 DNAJB8Q8NHS0 232 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SSC4DQ8WTU2 575 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 NPAS2Q99743 824 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SLX1AQ9BQ83 275 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 PCTPQ9UKL6 214 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.02□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 LRRK2Q5S007 2527 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 OR7A17O14581 309 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 MAN1A2O60476 641 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SLU7O95391 586 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 GCAP28676 217 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CD96P40200 585 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 MLF1P58340 268 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SLAMF1Q13291 335 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CUL3Q13618 768 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 RNF175Q8N4F7 328 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM178AQ8NBL3 297 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 MDS2Q8NDY4 140 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 OR14A16Q8NHC5 309 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 NR4A3Q92570 626 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 NCLNQ969V3 563 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TAAR6Q96RI8 345 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 NTMT1Q9BV86 223 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 LRFN1Q9P244 771 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SCN2AQ99250 2005 aa15.01□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TGFBR3LH3BV60 316 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 PLPP1O14494 284 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SEMA7AO75326 666 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 OTCP00480 354 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 COX7A2P14406 83 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TNNI3P19429 210 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 PPP2R1BP30154 601 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CYB561P49447 251 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 IFT88Q13099 833 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CYP20A1Q6UW02 462 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 GPR180Q86V85 440 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 WDR20Q8TBZ3 569 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 ACMSDQ8TDX5 336 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM125Q96AQ2 219 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CDK15Q96Q40 435 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SERPINI1Q99574 410 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 KLHL1Q9NR64 748 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 VTI1BQ9UEU0 232 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 PPT2Q9UMR5 302 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SLC5A6Q9Y289 635 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 HECTD1Q9ULT8 2610 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 A8MT66 165 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 DYRK3O43781 588 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 LDB3O75112 727 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 ZFAND5O76080 213 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SEMA3DO95025 777 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 MLYCDO95822 493 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 DDAH2O95865 285 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TNFRSF17Q02223 184 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TRAF3Q13114 568 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 FRG2Q64ET8 278 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SPINK14Q6IE38 97 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 NUDT13Q86X67 352 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 MORN4Q8NDC4 146 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.016e-11■■■■■ 51.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms