RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 THSD1Q9NS62 852 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R9Q9NYW1 312 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FEZF1A0PJY2 475 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZAR1LA6NP61 321 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 RFXAPO00287 272 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ARHGAP33O14559 1287 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SNPHO15079 494 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LRRTM2O43300 516 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TPST2O60704 377 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MMP20O60882 483 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LILRB5O75023 590 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GPX5O75715 221 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ARAFP10398 606 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CSF2RAP15509 400 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PSMB5P28074 263 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PIK3CBP42338 1070 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DSTNP60981 165 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TAP2Q03519 686 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF33BQ06732 778 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CNTN1Q12860 1018 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HSPB3Q12988 150 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LILRA6Q6PI73 481 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PAQR6Q6TCH4 344 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC80Q76M96 950 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GDPD3Q7L5L3 318 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SZRD1Q7Z422 152 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 C11orf74Q86VG3 221 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 COMTD1Q86VU5 262 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 NLRP8Q86W28 1048 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CACUL1Q86Y37 369 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LACC1Q8IV20 430 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 METTL4Q8N3J2 472 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 AMER2Q8N7J2 671 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KBTBD8Q8NFY9 601 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OR5AR1Q8NGP9 310 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TIFAQ96CG3 184 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM19Q96HH6 336 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 F2RL3Q96RI0 385 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MGLLQ99685 303 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM38AQ9H6F2 299 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MARCH7Q9H992 704 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 MYNNQ9NPC7 610 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TDP1Q9NUW8 608 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ALPK3Q96L96 1907 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SMIM30A4D0T7 59 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ANKDD1BA6NHY2 528 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PSMD11O00231 422 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PLPP1O14494 284 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF197O14709 1029 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 KMOO15229 486 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 SH3BP5O60239 455 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 APOL3O95236 402 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GSTT2P0CG29 244 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 GSTT2BP0CG30 244 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 S100A5P33763 92 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 HOXD12P35452 270 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CRISP1P54107 249 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 PNLIPRP1P54315 467 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 UGT2B15P54855 530 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ERVFC1P60507 584 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CDC42P60953 191 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 WDR5P61964 334 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 CSNK2BP67870 215 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 TUBA1BP68363 451 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.93□□□□□ -1.3
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