RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338045.7

LIMS1-202, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-202ENST00000338045 GSTA4O15217 222 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 AIFM1O95831 613 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 RETP07949 1114 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 MAGEA8P43361 318 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 MAP7Q14244 749 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 ADRM1Q16186 407 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 IRGCQ6NXR0 463 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 PTOV1Q86YD1 416 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 SLC35F3Q8IY50 421 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 DTWD2Q8NBA8 298 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 OR52N2Q8NGI0 321 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 FIG4Q92562 907 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-202ENST00000338045 MAP3K3Q99759 626 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-202ENST00000338045 IL21RQ9HBE5 538 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa14.65□□□□□ -0.06
LIMS1-202ENST00000338045 LRIT1Q9P2V4 623 aa14.65□□□□□ -0.06
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LIMS1-202ENST00000338045 LAMA1P25391 3075 aa14.64□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 PEX1O43933 1283 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CREG1O75629 220 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GLB1P16278 677 aa14.64□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 IL10P22301 178 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PEX2P28328 305 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NR1D2Q14995 579 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TRIP10Q15642 601 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 VMACQ2NL98 169 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TBCELQ5QJ74 424 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 LPCAT4Q643R3 524 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SLC48A1Q6P1K1 146 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CSNK1A1LQ8N752 337 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FAM110BQ8TC76 370 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 TCTN2Q96GX1 697 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 AURKCQ9UQB9 309 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa14.64□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 A0A1B0GTQ1 180 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 NTRK1P04629 796 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 UQCRC2P22695 453 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GPR3P46089 330 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 VAC14Q08AM6 782 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FADDQ13158 208 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 VEZF1Q14119 521 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 CEBPEQ15744 281 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DEFB134Q4QY38 66 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 C18orf63Q68DL7 685 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ERMP1Q7Z2K6 904 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.63□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 VCX3BQ9H321 246 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 EPB41L1Q9H4G0 881 aa14.63□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 TLCD2A6NGC4 264 aa14.63□□□□□ -0.07
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LIMS1-202ENST00000338045 HOXD12P35452 270 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 GABRA4P48169 554 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 AP1ARQ63HQ0 302 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.63□□□□□ -0.07
LIMS1-202ENST00000338045 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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