RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 FKBP9P1Q75LS8 142 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ASPGQ86U10 573 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 WNT16Q9UBV4 365 aa16.97■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.97■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JNG1 304 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 A0A0J9YVX5 310 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 METTL12A8MUP2 240 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TMEM229AB2RXF0 380 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 KIR2DS3K7RE56 304 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 MAP3K13O43283 966 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 B4GALT2O60909 372 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 DIRAS1O95057 198 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 CLIC3O95833 236 aa16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 JUNDP17535 347 aa16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 ALDH3A2P51648 485 aa16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 BTN3A2P78410 334 aa16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 TEAD4Q15561 434 aa16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 C18orf63Q68DL7 685 aa16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 DHRSXQ8N5I4 330 aa16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 OR5K1Q8NHB7 308 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
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ACTB-201ENST00000331789 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 RAD21L1Q9H4I0 556 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 TAS2R7Q9NYW3 318 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 U3KQV3 271 aa16.96■□□□□ 0.31
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GTW7 788 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 OR5K4A6NMS3 321 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 OPN1SWP03999 348 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ALPLP05186 524 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 LINGO3P0C6S8 592 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PVRP15151 417 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PRKACGP22612 351 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 DCTP40126 519 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 VLDLRP98155 873 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SAXO2Q658L1 398 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SPESP1Q6UW49 350 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SVOPLQ8N434 492 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 NEURL3Q96EH8 262 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 OR2A5Q96R48 311 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 LRRC61Q9BV99 259 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 GLIPR2Q9H4G4 154 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 EVA1BQ9NVM1 165 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ADPRHL2Q9NX46 363 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PADI4Q9UM07 663 aa16.96■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 P2RX6O15547 441 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SUV39H1O43463 412 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 NOBOXO60393 691 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 TNFAIP8O95379 198 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 AIFM1O95831 613 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 FABP3P05413 133 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 MYF6P23409 242 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 CD27P26842 260 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 CAPGP40121 348 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ARFIP1P53367 373 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 KCNJ10P78508 379 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 CDK6Q00534 326 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 RBBP4Q09028 425 aa16.95■□□□□ 0.3
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF750Q32MQ0 723 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SPDYE7PQ495Y7 208 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 RNF220Q5VTB9 566 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 KRT80Q6KB66 452 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 C6orf120Q7Z4R8 191 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 HORMAD2Q8N7B1 307 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SDCCAG3Q96C92 435 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 SHDQ96IW2 340 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 GUCD1Q96NT3 240 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.95■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.94■□□□□ 0.3
ACTB-201ENST00000331789 A0A1W2PR77 199 aa16.94■□□□□ 0.3
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