RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 SLC15A1P46059 708 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 KCNJ10P78508 379 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CEACAM20Q6UY09 585 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF675Q8TD23 568 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 F2RL3Q96RI0 385 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 BTBD2Q9BX70 525 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 RETREG1Q9H6L5 497 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 KMOO15229 486 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PRAMEF10O60809 474 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 POP7O75817 140 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PSMB5P28074 263 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 VIPR2P41587 438 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ELP6Q0PNE2 266 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TSTQ16762 297 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ANXA8L1Q5VT79 327 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SLC38A4Q969I6 547 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 IL36AQ9UHA7 158 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TAC3Q9UHF0 121 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 HS3ST2Q9Y278 367 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 H3BUI4 141 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SCN2BO60939 215 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ADH1AP07327 375 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ASMTP46597 345 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CAMKK1Q8N5S9 505 aa18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 RFXAPO00287 272 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 GSTM1P09488 218 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 LAG3P18627 525 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF763Q0D2J5 394 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 DOK4Q8TEW6 326 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CDADC1Q9BWV3 514 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 DUSP21Q9H596 190 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ITGAMP11215 1152 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 RAE1P78406 368 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 DUSP7Q16829 419 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 OR5AR1Q8NGP9 310 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 GANCQ8TET4 914 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 GGHQ92820 318 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 MYDGFQ969H8 173 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 OR5M11Q96RB7 305 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 DYRK4Q9NR20 520 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SNTG1Q9NSN8 517 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TAS2R9Q9NYW1 312 aa18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 H7BY64 318 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ADAMDEC1O15204 470 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PSMA3P25788 255 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ITGA1P56199 1179 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SELENOWP63302 87 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TUBA1BP68363 451 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 KRT33BQ14525 404 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 AGAP6Q5VW22 663 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 BRAT1Q6PJG6 821 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TUBA1AQ71U36 451 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PRAP1Q96NZ9 151 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 AGAP4Q96P64 663 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PHOX2BQ99453 314 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 NLNQ9BYT8 704 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 REEP4Q9H6H4 257 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 TM7SF3Q9NS93 570 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 STOML2Q9UJZ1 356 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SNX11Q9Y5W9 270 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 DSCR3O14972 297 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PCDH8O95206 1070 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ERVFC1P60507 584 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PROX2Q3B8N5 592 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PAMR1Q6UXH9 720 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 IQCF1Q8N6M8 205 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 EQTNQ9NQ60 294 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PIPSLA2A3N6 862 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 METTL15A6NJ78 407 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 RHOP08100 348 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 MPC1LP0DKB6 136 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 IL18R1Q13478 541 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 LRRC26Q2I0M4 334 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SPRED2Q7Z698 418 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ADIPOR2Q86V24 386 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 SFTPA1Q8IWL2 248 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 MMP27Q9H306 513 aa18.97■□□□□ 0.63
SPNS2-201ENST00000329078 XKR8Q9H6D3 395 aa18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms