RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298316.6

ARF6-201, Transcript of ADP ribosylation factor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARF6, Length 3,865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6-201ENST00000298316 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 POM121BA6NF01 834 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 LMX1AQ8TE12 382 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 A6NL46 340 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 FRS3O43559 492 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 TNFRSF21O75509 655 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 PRR5P85299 388 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 RAB39AQ14964 217 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 XKR7Q5GH72 579 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 TMEM107Q6UX40 140 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 SVOPQ8N4V2 548 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 NCSTNQ92542 709 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 SCN5AQ14524 2016 aa14.97□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 PDE9AO76083 593 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CCNB2O95067 398 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 ACSL1P33121 698 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 BMXP51813 675 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 SNAPC1Q16533 368 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 USP53Q70EK8 1073 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 TMIEQ8NEW7 156 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 MCFD2Q8NI22 146 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 GAL3ST4Q96RP7 486 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 SLC6A16Q9GZN6 736 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CLMPQ9H6B4 373 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 MYL12BO14950 172 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 RGS10O43665 173 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 ETHE1O95571 254 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 NPPAP01160 153 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 C8BP07358 591 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 MPIP34949 423 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 UGT8Q16880 541 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 KIAA1211LQ6NV74 962 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CDK20Q8IZL9 346 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 OR52E1Q8NGJ3 308 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 OR2L2Q8NH16 312 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 STON2Q8WXE9 905 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CLN6Q9NWW5 311 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CEPT1Q9Y6K0 416 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CCRL2O00421 344 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 MOSPD3O75425 235 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 NPPBP16860 134 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CTBSQ01459 385 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 PMS2P3Q13401 168 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 SLC22A16Q86VW1 577 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 SVOPLQ8N434 492 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 FAR1Q8WVX9 515 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 PPT2Q9UMR5 302 aa14.96□□□□□ -0.01
ARF6-201ENST00000298316 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 SAGP10523 405 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 ACPPP15309 386 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 CERS1P27544 350 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 MLLT10P55197 1068 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 ARPC4P59998 168 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 NPTX1Q15818 432 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 PDZD3Q86UT5 571 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 OXR1Q8N573 874 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 PATE1Q8WXA2 126 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 TADA1Q96BN2 335 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 MTERF3Q96E29 417 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 DKK3Q9UBP4 350 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 PPM1DO15297 605 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 B3GALT2O43825 422 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 UGT2B11O75310 529 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 ATE1O95260 518 aa14.95□□□□□ -0.02
ARF6-201ENST00000298316 IGHA2P01877 340 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms