RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295992.7

PCOLCE2-201, Transcript of procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PCOLCE2, Length 2,021 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2-201ENST00000295992 DTD2Q96FN9 168 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ARAFP10398 606 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CD40LGP29965 261 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 GJA4P35212 333 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CTSKP43235 329 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 HMGA2P52926 109 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 C2orf80Q0P641 193 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TDGQ13569 410 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TIGD6Q17RP2 521 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 C12orf40Q86WS4 652 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 DENND6BQ8NEG7 585 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 MTERF3Q96E29 417 aa22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 AIREO43918 545 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 RECKO95980 971 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TGFB1P01137 390 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 GADD45AP24522 165 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PPP5CP53041 499 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CDK6Q00534 326 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRIM74Q86UV6 250 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRIM73Q86UV7 250 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 MCFD2Q8NI22 146 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CHFRQ96EP1 664 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR51B5Q9H339 312 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 INIPQ9NRY2 104 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ACER3Q9NUN7 267 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 COL4A3Q01955 1670 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 J3KTA2 159 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRAMEF10O60809 474 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ATP6V1G1O75348 118 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ITGA2P17301 1181 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 GRK5P34947 590 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TAP2Q03519 686 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 INAVAQ3KP66 663 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ERAP2Q6P179 960 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 RNF130Q86XS8 419 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 DEPDC4Q8N2C3 294 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR9Q2Q8NGE9 314 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 OR52J3Q8NH60 311 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 MMP27Q9H306 513 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.18■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 SAP18O00422 153 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CBLP22681 906 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CADM3Q8N126 398 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PIP5K1AQ99755 562 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 A3GALT2U3KPV4 340 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.17■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 STSP08842 583 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CISD3P0C7P0 127 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ADORA3P0DMS8 318 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 FUT4P22083 530 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 SLC6A11P48066 632 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CLK1P49759 484 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 NUDT6P53370 316 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TAS2R50P59544 299 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF404Q494X3 552 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 IER5LQ5T953 404 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 LACC1Q8IV20 430 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 CFAP206Q8IYR0 622 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ZNF675Q8TD23 568 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 COL21A1Q96P44 957 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 AMBNQ9NP70 447 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ITM2CQ9NQX7 267 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 GPR83Q9NYM4 423 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 TMEM221A6NGB7 291 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PCDH17O14917 1159 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 SRFP11831 508 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 OPRD1P41143 372 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PIK3CBP42338 1070 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 PRIM2P49643 509 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 STARD3Q14849 445 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 FBXO43Q4G163 708 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 USP43Q70EL4 1123 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 VN1R5Q7Z5H4 357 aa22.16■■□□□ 1.14
PCOLCE2-201ENST00000295992 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms