RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000053716.7

Clrn3-201, Transcript of Clarin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clrn3, Length 3,305 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prokr2Q8K458 381 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r185Q8R299 319 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Taf12Q8VE65 161 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr450Q8VF81 310 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr722Q8VFC8 308 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Grip1Q925T6 1127 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zswim7Q9CWQ2 152 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps19Q9CZX8 145 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 9230112D13RikQ9D260 137 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr701Q9D3U9 316 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex19.2Q9D5S1 317 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspb11Q9D6H2 143 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sacm1lQ9EP69 587 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r65Q9EPS7 332 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tp73Q9JJP2 631 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Acsl4Q9QUJ7 711 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Adamts5Q9R001 930 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Orc6Q9WUJ8 262 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Srd5a3Q9WUP4 330 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Col24a1Q30D77 1733 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 PtprsB0V2N1 1907 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ralgps1A2AR50 585 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trmt1lA2RSY6 728 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H60cB1B213 197 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Trim12cD3Z3L3 497 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm20431E9PY39 371 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn2r106E9PY92 862 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 A430033K04RikE9Q8G5 680 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Prss56F2YMG0 604 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vmn1r176G3UW31 304 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Abcb1aP21447 1276 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cdc42P60766 191 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gpr143P70259 405 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rps5P97461 204 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gjb5Q02739 271 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CkbQ04447 381 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ubxn2bQ0KL01 331 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CrtamQ149L7 389 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ccdc177Q3UHB8 706 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Elavl4Q61701 385 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pkp4Q68FH0 1190 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gramd2bQ6PEM6 445 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Phf24Q80TL4 400 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Commd7Q8BG94 200 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pomt2Q8BGQ4 820 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q8BL95 290 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rgs7bpQ8BQP9 257 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Palm2Q8BR92 376 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pp2d1Q8BVT6 620 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 D2hgdhQ8CIM3 535 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Scara5Q8K299 491 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 NotumQ8R116 503 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Klhl25Q8R2P1 589 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Spon1Q8VCC9 807 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr96Q8VFE3 313 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr818Q8VG46 318 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr541Q8VGM0 312 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx4Q91YJ2 450 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mzt2Q9CQ25 159 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Q9CQ90 155 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Snx20Q9D2Y5 313 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm17190V9GX38 357 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tp53bp1P70399 1969 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Mgat4eA6H684 439 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ttc23lA6H6E9 458 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm2956E9PVJ0 216 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Tex264E9Q137 309 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm5796E9Q7M8 205 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm9857F7CXR1 130 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr171G5E8J1 314 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm11236J3QMS7 360 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm3629K7N6Y2 205 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm10340K7N708 205 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gm8108K7N734 216 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 H2-Q1O19441 368 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Socs5O54928 536 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sap18O55128 153 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 JtbO88824 146 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Zfp28P10078 825 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 FurinP23188 793 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Cd19P25918 547 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Gbx2P48031 348 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Alox12eP55249 662 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 DsppP97399 934 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sox14Q04892 240 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 CfiQ61129 603 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Stard3Q61542 446 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Ppp3r2Q63811 179 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Sdc3Q64519 442 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Lemd2Q6DVA0 511 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Vwa2Q70UZ7 791 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Oog2Q7TPX8 476 aa6.33□□□□□ -1.4
Clrn3-201ENSMUST00000053716 Olfr1152Q7TR34 310 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25.7 ms