RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049074.12

Ptprf-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ptprf, Length 7,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Clic5Q8BXK9 251 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 FRRS1Q8K385 592 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Camk1Q91YS8 374 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ogfod2Q9CQ04 349 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ceacam20Q9D2Z1 577 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 SrpraQ9DBG7 636 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm5796E9Q7M8 205 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm11236J3QMS7 360 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm3542K7N6U2 270 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm3629K7N6Y2 205 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10340K7N708 205 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm3696K7N751 203 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm8281L7N235 204 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ctla4P09793 223 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Htr4P97288 388 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Taar7aQ5QD12 358 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tnfrsf8Q60846 498 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr109Q8VG96 314 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Akap11E9Q777 1895 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r85G3UW56 850 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm10721J3QPJ9 223 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Emp3O35912 163 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Igfbp2P47877 305 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Tex52Q3TTI8 308 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Snx33Q4VAA7 574 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 FcrlbQ5DRQ8 427 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ubqln1Q8R317 582 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ddit4lQ8VHZ5 193 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Dapl1Q9D757 107 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ropn1Q9ESG2 212 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cngb3Q9JJZ9 694 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr671A0A1B0GSN5 317 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ifi203O35368 408 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arf3P61205 181 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arf1P84078 181 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pcsk7Q61139 770 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gpr75Q6X632 540 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q9D112 206 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Epb41l4bQ9JMC8 527 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nme7Q9QXL8 395 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Htra1Q9R118 480 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 BC034090A0A087WP46 1202 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 IspdQ5RJG7 447 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pon3Q62087 354 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1090Q8VGA6 313 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Wdr61Q9ERF3 305 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Jph1Q9ET80 660 aa16.84■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r30K7N5W1 852 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Vmn2r47K7N709 852 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cops4O88544 406 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Camk2aP11798 478 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1208Q8VG47 308 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Haus8Q99L00 373 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ska1Q9CPV1 254 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Eif4e3Q9DBB5 207 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Capn5O08688 640 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Nfatc2Q60591 927 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Arhgef4Q7TNR9 484 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Pqlc1Q80XM9 271 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8VDP2 222 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr1325Q8VF43 315 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Atg12Q9CQY1 141 aa16.83■□□□□ 0.29
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ccrl2O35457 360 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 NagluO88325 739 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zp2P20239 713 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 HexaP29416 528 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Rnase12Q5GAM8 145 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cdh24Q6PFX6 781 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Msantd1Q8BIL2 278 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ubr7Q8BU04 425 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Zmynd11Q8R5C8 602 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc25a11Q9CR62 314 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Olfr420E9Q4G0 321 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Usp2O88623 613 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Gm45902Q3UDN3 361 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Taf1cQ6PDZ2 836 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Q8C0X8 640 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Capn8Q91VA3 703 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fam13cQ9DBR2 601 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 GhrP16882 650 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Cyp4b1Q64462 511 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Slc41a3Q921R8 488 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 H2bfmQ9DAB5 224 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Bex6Q3TZW7 114 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Smco3Q8BQM7 225 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 LaynQ8C351 381 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Ndst3Q9EQH7 873 aa16.83■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myh14Q6URW6 2000 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Myh3P13541 1940 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Skint10A7TZG1 354 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Izumo4D3Z690 227 aa16.82■□□□□ 0.28
Ptprf-201ENSMUST00000049074 Itga10E9Q6R1 1167 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms