RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acvr2aP27038 513 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stfa3P35173 103 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc11a1P41251 548 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CratP47934 626 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam169aQ5XG69 665 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem164Q6PHN7 296 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r38Q7TQA6 331 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup21Q80YX8 181 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcppQ8CE08 381 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Utp4Q8R2N2 686 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem246Q91YV9 403 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Metap1dQ9CPW9 335 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fabp12Q9DAK4 132 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa12.13□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6592A2AHC7 168 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp809G3X9G7 402 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1121L7MTT1 314 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc32a1O35633 525 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxb3P09026 433 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf4P47741 272 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pdss2Q33DR3 401 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp39Q3TIX9 564 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kcnk12Q76M80 430 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1313Q7TQW8 311 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1051Q7TR76 308 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr384Q7TRX8 312 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr169Q7TS53 313 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hyal5Q812F3 526 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc3hav1lQ8BFR1 296 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptbp3Q8BHD7 523 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb46Q8BID6 600 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SheQ8BSD5 492 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pih1d2Q8CHR9 315 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sphk1Q8CI15 382 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm42417Q8K1D0 126 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chst15Q91XQ5 561 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhga6Q91XY2 932 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CPZ3 230 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NarfQ9CYQ7 462 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yipf5Q9EQQ2 257 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2h2Q9JIB4 396 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm35911A0A1D5RLS7 214 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc163A2AGD7 326 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-D1P14427 368 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cct7P80313 544 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd80Q00609 306 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Apcdd1Q3U128 514 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh16a1Q571I9 802 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chsy3Q5DTK1 884 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taar7fQ5QD08 358 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc85bQ6PDY0 202 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdh8Q7TSK3 1070 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl20Q80ZM3 255 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrnb3Q8BMN3 464 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb22Q8BVC1 179 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npsr1Q8BZP8 371 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B3gnt7Q8K0J2 397 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Masp2Q91WP0 685 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk6Q91Y82 253 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Asb6Q91ZU1 418 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gemin6Q9CX53 166 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sesn3Q9CYP7 492 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp5oQ9DB20 213 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clca3a1Q9QX15 902 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CorinQ9Z319 1113 aa12.12□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vti1bO88384 232 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csf2rb2P26954 878 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps14P62264 151 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr4a2Q06219 598 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fzd4Q61088 537 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TifaQ793I8 184 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr309Q7TS01 308 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700001J03RikQ80ZR8 219 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 QpctlQ8BH73 383 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eme1Q8BJW7 570 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MdficQ8BX65 247 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Thap1Q8CHW1 210 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ttc4Q8R3H9 386 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr525Q8VGL5 309 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr659Q8VGV6 322 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mthfd1Q922D8 935 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc8b1Q925Q3 585 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nudt14Q9D142 222 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rcan2Q9JHG2 197 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PnckQ9QYK9 343 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcsk5Q04592 1877 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ascc3E9PZJ8 2198 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A286YDU1 74 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 R3hdmlA2A5I3 253 aa12.11□□□□□ -0.47
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col9a3A2ACT7 680 aa12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.6 ms