RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 UBXN8O00124 270 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CYR61O00622 381 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 NME2P1O60361 137 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CTNSO60931 367 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 EPB42P16452 691 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 NME2P22392 152 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CERS1P27544 350 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 COL8A1P27658 744 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 DCTP40126 519 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CA7P43166 264 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MSH2P43246 934 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC7A5Q01650 507 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CHSY3Q70JA7 882 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 LAS2Q8IYD9 372 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM47BQ8NA70 645 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 NXNL1Q96CM4 212 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 FRMD6Q96NE9 622 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 F2RL3Q96RI0 385 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MS4A8Q9BY19 250 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ADGRE2Q9UHX3 823 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 SLC19A2O60779 497 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ZFAND5O76080 213 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 C2P06681 752 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ACAP2Q15057 778 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MROH9Q5TGP6 573 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF787Q6DD87 383 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 KLC3Q6P597 504 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 RPTNQ6XPR3 784 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 NCLNQ969V3 563 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGED4Q96JG8 741 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CENPKQ9BS16 269 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRC1Q9BTT6 524 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ASB1Q9Y576 335 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CCL21O00585 134 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 SCELO95171 688 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 IFNA16P05015 189 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 PCNAP12004 261 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 MTHFD2P13995 350 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 GMPRP36959 345 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 SERPINB8P50452 374 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 GPR143P51810 404 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 STX4Q12846 297 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 SERTAD2Q14140 314 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 GRHL2Q6ISB3 625 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 RELL1Q8IUW5 271 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 TMEM156Q8N614 296 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 OR7G3Q8NG95 312 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 CSF3RQ99062 836 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ACSS3Q9H6R3 686 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 SNX15Q9NRS6 342 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ITPR2Q14571 2701 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 A0A096LPK6 155 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ASNA1O43681 348 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ITGA10O75578 1167 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 KLHL2O95198 593 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 GFAPP14136 432 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 ZNF24P17028 368 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 TYK2P29597 1187 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRVP-204ENST00000639439 PPP2R1BP30154 601 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.5 ms