RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 LHPPQ9H008 270 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.83■■□□□ 1.25
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM233B4DJY2 109 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR7A17O14581 309 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 DSCR3O14972 297 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 KLHL18O94889 574 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RPN2P04844 631 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 T-ENOLP0DO92 83 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN8P19075 237 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ESAMQ96AP7 390 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 NSL1Q96IY1 281 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52B2Q96RD2 323 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 IRAK4Q9NWZ3 460 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPS1Q9UHF7 1281 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 F8P00451 2351 aa22.82■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR47O94967 919 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHA3P29320 983 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PRDX6P30041 224 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B2P37059 387 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SCTRP47872 440 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB28P51157 221 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TDGF1P3P51864 188 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ARSFP54793 590 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PER3P56645 1201 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TRAF3Q13114 568 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RBBP7Q16576 425 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MYO7BQ6PIF6 2116 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.245e-7■■■□□ 15.7
CAPNS1-216ENST00000628306 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR56A3Q8NH54 315 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CUTCQ9NTM9 273 aa22.81■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 FITM1A5D6W6 292 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 UGDHO60701 494 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CRCPO75575 148 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 GRIA3P42263 894 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1D4P47884 311 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CCNG1P51959 295 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CORO7P57737 925 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF33BQ06732 778 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TLR1Q15399 786 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR9A1PQ8NGU1 263 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP6V1E2Q96A05 226 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD51AP1Q96B01 352 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 IL17FQ96PD4 163 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PKP4Q99569 1192 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF385DQ9H6B1 395 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC11Q9NVH1 559 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.8■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CALB2P22676 271 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 GRNP28799 593 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 GDF5P43026 501 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MFAP5Q13361 173 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP19Q14CB8 494 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC6AQ6EIG7 209 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 AGTRAPQ6RW13 159 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 FJX1Q86VR8 437 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMF1Q92530 271 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RELTQ969Z4 430 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TAAR6Q96RI8 345 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GTL3 188 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CTSVO60911 334 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP4BP51164 291 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MNAT1P51948 309 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXA1P55317 472 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OGFOD2Q6N063 350 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 FIGLAQ6QHK4 219 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 LINC00696Q6ZRV3 163 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 MCEMP1Q8IX19 187 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 OR4F6Q8NGB9 312 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP61Q8NHU2 1237 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 METTL6Q8TCB7 284 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 LMF1Q96S06 567 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.78■■□□□ 1.24
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.78■■□□□ 1.24
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