RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SAMD12Q8N8I0 201 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR5B17Q8NGF7 314 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10T2Q8NGX3 314 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CDC6Q99741 560 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SPIN2AQ99865 258 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ACP6Q9NPH0 428 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 BIN3Q9NQY0 253 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CLDND1Q9NY35 253 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC7A8Q9UHI5 535 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NME7Q9Y5B8 376 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MYO5CQ9NQX4 1742 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 UGT1A9O60656 530 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SLITRK5O94991 958 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CRYZL1O95825 349 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 APOC3P02656 99 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ALDOBP05062 364 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NUDT7P0C024 238 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 UGT1A6P19224 532 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 EPHA1P21709 976 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FBLP22087 321 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 AK4P27144 223 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CHATP28329 748 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CD34P28906 385 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 L1CAMP32004 1257 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CSKP41240 450 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 NUDT6P53370 316 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 HERVK_113P63132 956 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 MZT1Q08AG7 82 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 POU4F2Q12837 409 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TBRG1Q3YBR2 411 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM205Q6UW68 189 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SCRN2Q96FV2 425 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 SGCZQ96LD1 299 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM209Q96SK2 561 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 CCDC32Q9BV29 185 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ERVK-6Q9BXR3 956 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FBRSQ9HAH7 460 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 UGT1A7Q9HAW7 530 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 UGT1A10Q9HAW8 530 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 UGT1A8Q9HAW9 530 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 TAS2R9Q9NYW1 312 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 RNF6Q9Y252 685 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 WDR45Q9Y484 360 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF536O15090 1300 aa3.9□□□□□ -1.78
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 EFCAB7A8K855 629 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PHYHO14832 338 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 IRF6O14896 467 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 WDPCPO95876 746 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OAS1P00973 400 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MMP3P08254 477 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ALPIP09923 528 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 H2AFB2P0C5Z0 115 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC2A1P11166 492 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 C6P13671 934 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 RORAP35398 523 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 BDKRB1P46663 353 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 RTP1P59025 263 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TAS2R39P59534 338 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC18A2Q05940 514 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 PTPRRQ15256 657 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FRG2Q64ET8 278 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4F3Q6IEY1 312 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 FSTL4Q6MZW2 842 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF695Q8IW36 515 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR4E2Q8NGC2 313 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 OR1S1Q8NH92 325 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 TERB2Q8NHR7 220 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC35F5Q8WV83 523 aa3.9□□□□□ -1.79
ANKRD28-215ENST00000624145 GAB3Q8WWW8 586 aa3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms