RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 GK3PQ14409 553 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ABHD13Q7L211 337 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR2L5Q8NG80 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR1J4Q8NGS1 313 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SUSD3Q96L08 255 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TAPBPLQ9BX59 468 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BEX1Q9HBH7 125 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DTLQ9NZJ0 730 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 COPS7AQ9UBW8 275 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CACNG2Q9Y698 323 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TRBC2A0A5B9 178 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR6C65A6NJZ3 312 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OAZ2O95190 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BPNT1O95861 308 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SRCP12931 536 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 IGFBP4P22692 258 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SSTP61278 116 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CDK5R2Q13319 367 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SIGIRRQ6IA17 410 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 F5H5P2 479 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 WNT9AO14904 365 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ADAM12O43184 909 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HSPA12AO43301 675 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CDK14O94921 469 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 IFNA1P01562 189 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BCKDHAP12694 445 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GRIN2CQ14957 1233 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SPCS2Q15005 226 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZMYND11Q15326 602 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HMGN3Q15651 99 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 BCL7AQ4VC05 210 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SPIN4Q56A73 249 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 C22orf42Q6IC83 251 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TAC4Q86UU9 113 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR13F1Q8NGS4 319 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PCED1BQ96HM7 432 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SHDQ96IW2 340 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SLC35G5Q96KT7 338 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RAD9AQ99638 391 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KCNH6Q9H252 994 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SIAEQ9HAT2 523 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 RCBTB2O95199 551 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 S100A8P05109 93 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ITGAMP11215 1152 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 KCNE1P15382 129 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GGT1P19440 569 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DPP6P42658 865 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEA11P43364 429 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PRKXP51817 358 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 CAPZA1P52907 286 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 MAXP61244 160 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 DUSP6Q16828 381 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF678Q5SXM1 525 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 GPR151Q8TDV0 419 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 HMCESQ96FZ2 354 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 LRCH3Q96II8 777 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.63□□□□□ -1.35
CLCN3-211ENST00000613795 REEP4Q9H6H4 257 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms