RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN8P19075 237 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TCN2P20062 427 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 HSPA13P48723 471 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBA1BP68363 451 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 APOFQ13790 326 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MTX3Q5HYI7 312 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FRMPD2BQ6IN97 320 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TUBA1AQ71U36 451 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CUZD1Q86UP6 607 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS58Q8IYP2 241 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4N4Q8N0Y3 316 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MR1Q95460 341 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DTNBP1Q96EV8 351 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA4CQ9C0C4 833 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FBXO8Q9NRD0 319 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 A8MT66 165 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF749O43361 778 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SUPT3HO75486 399 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FURINP09958 794 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM87AP0C7U9 286 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 UBL4AP11441 157 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PCSK6P29122 969 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DLSTP36957 453 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CHAF1BQ13112 559 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TECRLQ5HYJ1 363 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CLEC6AQ6EIG7 209 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 D2HGDHQ8N465 521 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DPH7Q9BTV6 452 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 B3GNT4Q9C0J1 378 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NDOR1Q9UHB4 597 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MAU2Q9Y6X3 613 aa11.94□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1W2PPV9 198 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2B3O76000 313 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 IPO13O94829 963 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN12O95859 305 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CYP2A7P20853 494 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 STX5Q13190 355 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM83EQ2M2I3 478 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ASB11Q8WXH4 323 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CIB1Q99828 191 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DPYSL5Q9BPU6 564 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CHST8Q9H2A9 424 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE10AQ9Y233 779 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SCN2AQ99250 2005 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A087X1B8 175 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC166P0CW27 439 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 GDF5P43026 501 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB15P59190 212 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CD83Q01151 205 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 POU4F1Q01851 419 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SQLEQ14534 574 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TTLL9Q3SXZ7 439 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ARMC4Q5T2S8 1044 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FCRL6Q6DN72 434 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CHSY3Q70JA7 882 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 OR2A1Q8NGT9 310 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 OR9A1PQ8NGU1 263 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC29A1Q99808 456 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 SPAG4Q9NPE6 437 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 ATAD3AQ9NVI7 634 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MKL2Q9ULH7 1088 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RNF11Q9Y3C5 154 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 FEZF1A0PJY2 475 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BSA7 217 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 H7BY64 318 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 M0QX08 132 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 MRASO14807 208 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 KPNA5O15131 536 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 CATP04040 527 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 C8BP07358 591 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NR1H2P55055 460 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS3P57727 454 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJB13P59910 316 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 RHDQ02161 417 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 NAE1Q13564 534 aa11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms