RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592385.5

HDAC5-211, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC5, Length 2,601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-211ENST00000592385 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 C12orf40Q86WS4 652 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 MCFD2Q8NI22 146 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 ITPKCQ96DU7 683 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 NLNQ9BYT8 704 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 OR52A5Q9H2C5 316 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 DSN1Q9H410 356 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 IMPAD1Q9NX62 359 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-211ENST00000592385 DENND4AQ7Z401 1863 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TBX19O60806 448 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CCNB2O95067 398 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 GADD45GO95257 159 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 RPA4Q13156 261 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PERM1Q5SV97 790 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 C9orf64Q5T6V5 341 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 REEP3Q6NUK4 255 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PAGE2Q7Z2X7 111 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 OR9Q2Q8NGE9 314 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF675Q8TD23 568 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PDXPQ96GD0 296 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CRELD1Q96HD1 420 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 FAM129BQ96TA1 746 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 RAB23Q9ULC3 237 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TRBC2A0A5B9 178 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM247A6NEH6 219 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 J3KTA2 159 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 MPZL2O60487 215 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 SERPINB7O75635 380 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 IFNW1P05000 195 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ADRB3P13945 408 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CEBPBP17676 345 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CD40LGP29965 261 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PPP5CP53041 499 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CDC42P60953 191 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 OLR1P78380 273 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ZNF404Q494X3 552 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 USP43Q70EL4 1123 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PDZD3Q86UT5 571 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 STX19Q8N4C7 294 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 RHBGQ9H310 441 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 AMBNQ9NP70 447 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 KCND3Q9UK17 655 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ASF1AQ9Y294 204 aa14.58□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CCDC88CQ9P219 2028 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 SH3D21A4FU49 640 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 KRBA1A5PL33 1030 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ZBBXA8MT70 800 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PCDH17O14917 1159 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 MMP20O60882 483 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 DDCP20711 480 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TGM1P22735 817 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 IRF3Q14653 427 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TCEAL5Q5H9L2 206 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 NEURL3Q96EH8 262 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ARMC7Q9H6L4 198 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 GPR83Q9NYM4 423 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 METTL15A6NJ78 407 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ADORA3P0DMS8 318 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ERGP11308 486 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 GADD45AP24522 165 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ARHGAP19Q14CB8 494 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 SAXO2Q658L1 398 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 POF1BQ8WVV4 589 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ING5Q8WYH8 240 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 NXPE3Q969Y0 559 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PELI2Q9HAT8 420 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 A4GALTQ9NPC4 353 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 IL23AQ9NPF7 189 aa14.57□□□□□ -0.08
HDAC5-211ENST00000592385 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms