RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570380.5

CTDNEP1-202, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-202ENST00000570380 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.6□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.59□□□□□ -0.87
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CTDNEP1-202ENST00000570380 ERN1O75460 977 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 F7P08709 466 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 FDFT1P37268 417 aa9.57□□□□□ -0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 CETN2P41208 172 aa9.57□□□□□ -0.88
CTDNEP1-202ENST00000570380 MAGEA1P43355 309 aa9.57□□□□□ -0.88
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