RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555082.5

PRKCH-211, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCH, Length 2,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-211ENST00000555082 HORMAD1Q86X24 394 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 OR2T29Q8NH02 315 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 RLN3Q8WXF3 142 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 HHIPQ96QV1 700 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 BEX2Q9BXY8 128 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 NUAK2Q9H093 628 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 EHD3Q9NZN3 535 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 GULP1Q9UBP9 304 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 H0Y8X5 98 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZW10O43264 779 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 LATO43561 262 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 OR56A5P0C7T3 313 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PDHA2P29803 388 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 CLDN2P57739 230 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 IL18R1Q13478 541 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 IRF4Q15306 451 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 SBSNQ6UWP8 590 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 P3H2Q8IVL5 708 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 EGFL8Q99944 293 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 BCL7BQ9BQE9 202 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 RUBCNLQ9H714 662 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 DUSP12Q9UNI6 340 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 COL4A2P08572 1712 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa9.5□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 HAT1O14929 419 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 KLK8O60259 260 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ACADMP11310 421 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 AOAHP28039 575 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ARHGDIAP52565 204 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZP2Q05996 745 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PNCKQ6P2M8 343 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 SIX5Q8N196 739 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 APH1BQ8WW43 257 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 RAB7BQ96AH8 199 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TPD52L3Q96J77 140 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PRRG3Q9BZD7 231 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 CCRL2O00421 344 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 STK25O00506 426 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 NPC1O15118 1278 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 APOA1P02647 267 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 NTRK1P04629 796 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 STSP08842 583 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 AQP1P29972 269 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TPMTP51580 245 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ABRQ12979 859 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 FAM209AQ5JX71 171 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 AGAP6Q5VW22 663 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZNF852Q6ZMS4 543 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ARMCX6Q7L4S7 300 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PPP3R2Q96LZ3 170 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 AGAP4Q96P64 663 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 NRTNQ99748 197 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TMEM246Q9BRR3 403 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 GPR83Q9NYM4 423 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 FAM170BA6NMN3 283 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 PTTG1O95997 202 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 RETP07949 1114 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TACR1P25103 407 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 IDH2P48735 452 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 DGKEP52429 567 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 DAB2P98082 770 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 FADDQ13158 208 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 TAB1Q15750 504 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 CCDC58Q4VC31 144 aa9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
PRKCH-211ENST00000555082 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms