RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525152.1

PPP6R3-208, Transcript of protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, human

TSL 2

Gene PPP6R3, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP6R3-208	ENST00000525152	KCNC1	P48547	511 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	HSPA7	P48741	367 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	MEOX1	P50221	254 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	LIM2	P55344	173 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	RAB10	P61026	200 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CAV1	Q03135	178 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	DOC2A	Q14183	400 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	E2F2	Q14209	437 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PDK4	Q16654	411 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	AGAP11	Q8TF27	550 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	NCLN	Q969V3	563 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CD244	Q9BZW8	370 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	LYRM4	Q9HD34	91 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CD274	Q9NZQ7	290 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	RNF112	Q9ULX5	631 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		13.94	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SSR4	P51571	173 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	IRF8	Q02556	426 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	BMPR2	Q13873	1038 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	OR4D1	Q15615	310 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SNX31	Q8N9S9	440 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	MORN4	Q8NDC4	146 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ESAM	Q96AP7	390 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	DPH5	Q9H2P9	285 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	MYOT	Q9UBF9	498 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TACC2	O95359	2948 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TFEC	O14948	347 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	C1QA	P02745	245 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	IFNA16	P05015	189 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	PTGS2	P35354	604 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	GTF3C1	Q12789	2109 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	STX4	Q12846	297 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CHIT1	Q13231	466 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	BIK	Q13323	160 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SERTAD2	Q14140	314 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	HSDL2	Q6YN16	418 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	MDGA2	Q7Z553	956 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ISCA2	Q86U28	154 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	FAM47B	Q8NA70	645 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	OR8K3	Q8NH51	312 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	F2RL3	Q96RI0	385 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	SPACA6	W5XKT8	324 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	FBN2	P35556	2912 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CCDC189	A1A4V9	331 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152		A8MVJ9	347 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	ADAM10	O14672	748 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	FANCG	O15287	622 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	RAD51C	O43502	376 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	HS6ST1	O60243	411 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	TUBB4A	P04350	444 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	EPOR	P19235	508 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PPP6R3-208	ENST00000525152	CD22	P20273	847 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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