RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511978.5

MATR3-218, Transcript of matrin 3, human

TSL 3

Gene MATR3, Length 573 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-218	ENST00000511978	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DPYS	Q14117	519 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CST6	Q15828	149 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CCDC6	Q16204	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DPYSL2	Q16555	572 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ACCSL	Q4AC99	568 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CDON	Q4KMG0	1287 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	C22orf39	Q6P5X5	142 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	H2AFV	Q71UI9	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	STK40	Q8N2I9	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DEFB119	Q8N690	84 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	TEKT4	Q8WW24	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	RTP4	Q96DX8	246 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CCDC114	Q96M63	670 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ZWILCH	Q9H900	591 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	KRT84	Q9NSB2	600 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	C1RL	Q9NZP8	487 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SUN2	Q9UH99	717 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CACNA1H	O95180	2353 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978		K7ERQ8	282 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	MCF2L	O15068	1137 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ALOX15B	O15296	676 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	MID1	O15344	667 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	KDELR3	O43731	214 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	LRP3	O75074	770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ZMPSTE24	O75844	475 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	PROSC	O94903	275 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	KDM4B	O94953	1096 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CLDN14	O95500	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SEMA4F	O95754	770 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CD160	O95971	181 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	GOT1	P17174	413 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	NFKBIA	P25963	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	OXTR	P30559	389 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ART1	P52961	327 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	METAP1	P53582	386 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF33A	Q06730	810 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DLG1	Q12959	904 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	KRT81	Q14533	505 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SPA17	Q15506	151 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DLG2	Q15700	870 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	PARP15	Q460N3	678 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	BOLA3	Q53S33	107 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	WDR73	Q6P4I2	378 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DPPA4	Q7L190	304 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	NPW	Q8N729	165 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	GANC	Q8TET4	914 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	TCEAL3	Q969E4	200 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	MTBP	Q96DY7	904 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	OR1F2P	Q96R84	312 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MATR3-218	ENST00000511978	PANX2	Q96RD6	677 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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