RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 LURAP1LQ8IV03 231 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PLD3Q8IV08 490 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CAMKVQ8NCB2 501 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HUS1BQ8NHY5 278 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SLC13A3Q8WWT9 602 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CMTM7Q96FZ5 175 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 IP6K3Q96PC2 410 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 GBP5Q96PP8 586 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 OR2A5Q96R48 311 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINI1Q99574 410 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CENPKQ9BS16 269 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NDC1Q9BTX1 674 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FAM107BQ9H098 131 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SPNS1Q9H2V7 528 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 C5AR2Q9P296 337 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PPT2Q9UMR5 302 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 COL12A1Q99715 3063 aa10.74□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEB17A8MXT2 336 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 H0YGG7 62 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MASP2O00187 686 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PIP5K1BO14986 540 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SERPIND1P05546 499 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINA6P08185 405 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SLC35G6P0C7Q6 338 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00032P0C843 101 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DRD4P21917 467 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 GABRA4P48169 554 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 AQP5P55064 265 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 BTKQ06187 659 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RGS1Q08116 209 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PWP1Q13610 501 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MYBPC3Q14896 1274 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ABRAXAS2Q15018 415 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NR6A1Q15406 480 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TCTE1Q5JU00 501 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DCAF10Q5QP82 559 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ACAD11Q709F0 780 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ASPGQ86U10 573 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 51.2
UBE2B-208ENST00000511807 GALNT16Q8N428 558 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD53Q8N9V6 530 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 OR2Y1Q8NGV0 311 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PROKR1Q8TCW9 393 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf60Q96EN9 201 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NUF2Q9BZD4 464 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 MEAF6Q9HAF1 191 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NPHS2Q9NP85 383 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ASF1BQ9NVP2 202 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 P4HTMQ9NXG6 502 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 AHSPQ9NZD4 102 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL14Q9P2G3 628 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 VPS29Q9UBQ0 182 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa10.73□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RELNP78509 3460 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 H3BMH7 237 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DIAPH2O60879 1101 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 FAM107AO95990 144 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TGFB1P01137 390 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 IGHEP01854 428 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CD63P08962 238 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ALAS2P22557 587 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 HTR6P50406 440 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ARFIP2P53365 341 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 RPS13P62277 151 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TGM3Q08188 693 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CUL3Q13618 768 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM35AQ53FP2 167 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DEPDC1Q5TB30 811 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TLDC1Q6P9B6 456 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 EPGNQ6UW88 154 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM151BQ8IW70 566 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 NT5CQ8TCD5 201 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 STON2Q8WXE9 905 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TUBGCP3Q96CW5 907 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 PPP3R2Q96LZ3 170 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 TUBB1Q9H4B7 451 aa10.72□□□□□ -0.69
UBE2B-208ENST00000511807 DMRT3Q9NQL9 472 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms