RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495422.1

TAF12-204, Transcript of TATA-box binding protein associated factor 12, human

TSL 5

Gene TAF12, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF12-204	ENST00000495422	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	SNPH	O15079	494 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	OR1F1	O43749	312 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	AKR1B10	O60218	316 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	GYPC	P04921	128 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	CDH1	P12830	882 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	PAX1	P15863	534 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	MC3R	P41968	323 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	TBPL1	P62380	186 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	ASB11	Q8WXH4	323 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	PROK2	Q9HC23	129 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	NCKAP5	O14513	1909 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TAF12-204	ENST00000495422	PJA2	O43164	708 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	ACSL3	O95573	720 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	FAM27E3	Q08E93	113 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PWP1	Q13610	501 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CA13	Q8N1Q1	262 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CALHM2	Q9HA72	323 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SMTNL1	A8MU46	457 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422		A8MXE2	369 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	GFY	I3L273	518 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	ZBTB14	O43829	449 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	TRAPPC6A	O75865	159 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	GDF1	P27539	372 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	GDF10	P55107	478 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	RNF4	P78317	190 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SLC13A2	Q13183	592 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	P3H1	Q32P28	736 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	VASN	Q6EMK4	673 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PRELID2	Q8N945	189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	LPGAT1	Q92604	370 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422		E5RI56	91 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	LRAT	O95237	230 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	IFNA16	P05015	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	FREM3	P0C091	2139 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CRYGS	P22914	178 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CPOX	P36551	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	SLCO1A2	P46721	670 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	COPS2	P61201	443 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	RGS1	Q08116	209 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CUL1	Q13616	776 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PHKG1	Q16816	387 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	AADACL2	Q6P093	401 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	MPP5	Q8N3R9	675 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	TC2N	Q8N9U0	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	NT5C	Q8TCD5	201 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TAF12-204	ENST00000495422	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms