RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493536.5

SNHG16-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG16, Length 2,424 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-202ENST00000493536 GLOD5A6NK44 160 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 C4orf51C9J302 202 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 H0YGG7 62 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CXCR6O00574 342 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 TPST1O60507 370 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 UMPSP11172 480 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ST6GAL1P15907 406 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CRATP43155 626 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CAPZBP47756 277 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 POLE2P56282 527 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 BNIP3Q12983 259 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SLC14A1Q13336 389 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 DEFB134Q4QY38 66 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 LPCAT4Q643R3 524 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PIGKQ92643 395 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PHF12Q96QT6 1004 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SEPHS2Q99611 448 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 NLNQ9BYT8 704 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ROGDIQ9GZN7 287 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 UCK1Q9HA47 277 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ANAPC2Q9UJX6 822 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 C15orf41Q9Y2V0 281 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 KLK4Q9Y5K2 254 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.36□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SH3BP5O60239 455 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 TIPRLO75663 272 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 GPX2P18283 190 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PEX2P28328 305 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 RELAQ04206 551 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 HSPB3Q12988 150 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 GAB1Q13480 694 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 FXNQ16595 210 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 MPEG1Q2M385 716 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 MTX3Q5HYI7 312 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CEP68Q76N32 757 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.079e-20■■■■■ 27.5
SNHG16-202ENST00000493536 C10orf111Q8N326 155 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ZFP90Q8TF47 636 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 LRTOMTQ8WZ04 291 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 NCSTNQ92542 709 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SLCO4A1Q96BD0 722 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PKP2Q99959 881 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 KLHL4Q9C0H6 718 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 GORASP2Q9H8Y8 452 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 C1orf226A1L170 272 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 P2RX6O15547 441 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 B3GALT2O43825 422 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 TBX19O60806 448 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SCELO95171 688 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 NTSP30990 170 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 GPC1P35052 558 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 CTSKP43235 329 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 TAF11Q15544 211 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SPDYE7PQ495Y7 208 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 PLK5Q496M5 336 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 RNF44Q7L0R7 432 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 LILRA2Q8N149 483 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 SLC25A45Q8N413 288 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 ARL10Q8N8L6 244 aa8.35□□□□□ -1.07
SNHG16-202ENST00000493536 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms