RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.132e-6■■■■□ 22.3
CTDSP1-211ENST00000492545 OR1C1Q15619 314 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PFKFB4Q16877 469 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 GRHL2Q6ISB3 625 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TEX9Q8N6V9 391 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM178AQ8NBL3 297 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ISL2Q96A47 359 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR78Q96P69 363 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CENPKQ9BS16 269 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PRM3Q9NNZ6 103 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TMCO1Q9UM00 188 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1B0GUH1 482 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 KRT38O76015 456 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SCELO95171 688 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 STSP08842 583 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 RBP1P09455 135 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 COL6A2P12110 1019 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CLCN2P51788 898 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TDGF1P3P51864 188 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 AP5B1Q2VPB7 878 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CEP112Q8N8E3 955 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 REPS1Q96D71 796 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SCMH1Q96GD3 660 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 VPS11Q9H270 941 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.13■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ZGRF1Q86YA3 2104 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 FCHO1O14526 889 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MYO1DO94832 1006 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MLYCDO95822 493 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PCNAP12004 261 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CERS1P27544 350 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ECHS1P30084 290 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MAGEA12P43365 314 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CYB561P49447 251 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MLF1P58340 268 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 DEPDC1Q5TB30 811 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 APCDD1LQ8NCL9 501 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 VMP1Q96GC9 406 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PAFAH2Q99487 392 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ACTR8Q9H981 624 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ADAP2Q9NPF8 381 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 LRFN1Q9P244 771 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 A8MUA0 341 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 H0YIV9 168 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PHEXP78562 749 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SERTAD2Q14140 314 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SPINK14Q6IE38 97 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CNPY4Q8N129 248 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM47BQ8NA70 645 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MS4A12Q9NXJ0 267 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.11■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 MAN1A2O60476 641 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 NEURL1O76050 574 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TGFB1P01137 390 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SP1P08047 785 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 HLCSP50747 726 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 BIKQ13323 160 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 GTF2H2Q13888 395 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 LGSNQ5TDP6 509 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC25A25Q6KCM7 469 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 GFRALQ6UXV0 394 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 IFT20Q8IY31 132 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 HUS1BQ8NHY5 278 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 RGMAQ96B86 450 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC77Q9BR77 488 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 IPPKQ9H8X2 491 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.1■■□□□ 1.13
CTDSP1-211ENST00000492545 SEC14L3Q9UDX4 400 aa22.1■■□□□ 1.13
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